218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30460 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30460  structural maintenance of chromosomes protein  100 
 
 		 1093 aa  2241    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.157057 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08742  structural maintenance of chromosome complex subunit SmcA (AFU_orthologue; AFUA_6G02700)  29.36 
 
 		 1185 aa  344  5e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183997  normal  0.16607 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  25.05 
 
 		 1076 aa  311  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06390  nucleus protein, putative  24.48 
 
 		 1157 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  24.16 
 
 		 1099 aa  260  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  23.64 
 
 		 1146 aa  77.4  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  34.19 
 
 		 1063 aa  75.9  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  29.3 
 
 		 1060 aa  64.3  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  21.6 
 
 		 1191 aa  62.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  21.84 
 
 		 1181 aa  62  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  23 
 
 		 1215 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  26.92 
 
 		 1208 aa  60.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 		 1222 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 		 1263 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  26.92 
 
 		 1125 aa  59.7  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  31.14 
 
 		 1183 aa  59.3  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  29.02 
 
 		 1188 aa  59.3  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  29.94 
 
 		 1234 aa  59.3  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  29.34 
 
 		 1198 aa  58.2  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  29.34 
 
 		 1198 aa  58.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  24.38 
 
 		 1172 aa  57.4  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  29.34 
 
 		 1188 aa  57.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  29.76 
 
 		 1191 aa  57.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  22.17 
 
 		 1191 aa  57.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  22.58 
 
 		 1196 aa  56.2  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  23.21 
 
 		 1011 aa  56.2  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  28.14 
 
 		 1217 aa  56.2  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  29.34 
 
 		 1227 aa  55.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  27.54 
 
 		 1172 aa  55.1  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 		 1188 aa  55.1  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 		 1185 aa  54.3  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  26.67 
 
 		 1191 aa  54.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  29.06 
 
 		 1174 aa  54.3  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  21.5 
 
 		 1188 aa  54.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  26.42 
 
 		 1179 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  22.45 
 
 		 1189 aa  53.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  23 
 
 		 1179 aa  53.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1391  SMC domain protein  24.56 
 
 		 526 aa  53.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  24.87 
 
 		 1191 aa  53.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  26.19 
 
 		 1148 aa  53.5  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  27.27 
 
 		 572 aa  52.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  26.95 
 
 		 1222 aa  52.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  27.56 
 
 		 1198 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 		 1190 aa  52.4  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  24.6 
 
 		 895 aa  52.4  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  26.95 
 
 		 1195 aa  52.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  35.48 
 
 		 1213 aa  52.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  29.89 
 
 		 702 aa  52.4  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  23.53 
 
 		 1199 aa  52.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0923  SMC domain protein  28.57 
 
 		 550 aa  52.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.757485 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  24.73 
 
 		 1213 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  28.17 
 
 		 1153 aa  52  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  22.58 
 
 		 1209 aa  52  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 		 1181 aa  52  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  22.78 
 
 		 1171 aa  52  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  24.4 
 
 		 1172 aa  52  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  24.59 
 
 		 1255 aa  52  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  23.11 
 
 		 1215 aa  51.6  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  26.55 
 
 		 565 aa  51.6  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  28.48 
 
 		 1214 aa  51.6  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  31.71 
 
 		 912 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  26.15 
 
 		 1198 aa  51.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 1540 aa  51.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  26.15 
 
 		 1198 aa  50.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  37.21 
 
 		 359 aa  50.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  20.59 
 
 		 1234 aa  50.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  22.63 
 
 		 1175 aa  50.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  24.36 
 
 		 702 aa  50.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  23.4 
 
 		 1183 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  28.14 
 
 		 1218 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  34.29 
 
 		 924 aa  50.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  21.61 
 
 		 1268 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  27.56 
 
 		 1174 aa  50.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  22.29 
 
 		 1184 aa  50.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 		 1194 aa  50.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  28.32 
 
 		 1184 aa  50.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.4 
 
 		 1201 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  31.4 
 
 		 1240 aa  50.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  26.95 
 
 		 1224 aa  50.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  19.89 
 
 		 1162 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  36.14 
 
 		 1202 aa  49.7  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  38.82 
 
 		 1207 aa  50.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.55 
 
 		 1171 aa  50.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  27.35 
 
 		 533 aa  49.7  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  27.54 
 
 		 1203 aa  49.7  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  21.11 
 
 		 1174 aa  49.7  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  26.95 
 
 		 1186 aa  50.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  23.03 
 
 		 1224 aa  49.7  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  21.11 
 
 		 1174 aa  49.7  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.08 
 
 		 1170 aa  49.3  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  22.6 
 
 		 1193 aa  49.3  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  21.94 
 
 		 1170 aa  49.3  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  27.12 
 
 		 578 aa  49.3  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 		 1206 aa  49.3  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  22.17 
 
 		 702 aa  49.3  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  30.71 
 
 		 1194 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_19472  predicted protein  26.71 
 
 		 1186 aa  49.3  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222049  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  22.05 
 
 		 1167 aa  48.9  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  30.3 
 
 		 357 aa  48.9  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  30.36 
 
 		 556 aa  48.9  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>