More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0923 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0923  SMC domain protein  100 
 
 		 550 aa  1077    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.757485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0777  SMC domain-containing protein  67.4 
 
 		 539 aa  700    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397479  normal  0.58729 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  63.27 
 
 		 537 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1216  SMC domain protein  58.21 
 
 		 531 aa  558  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0021  SMC domain protein  49.36 
 
 		 533 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2848  SMC domain protein  51.12 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.84 
 
 		 558 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.22 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  32.57 
 
 		 565 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.39 
 
 		 580 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  35.86 
 
 		 611 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.99 
 
 		 573 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  34.97 
 
 		 578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.11 
 
 		 554 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 554 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.5 
 
 		 570 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  34.77 
 
 		 549 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.22 
 
 		 573 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  29.2 
 
 		 552 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  29.34 
 
 		 555 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  34.71 
 
 		 553 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  31.42 
 
 		 572 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  34.36 
 
 		 553 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 556 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  32.23 
 
 		 574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 		 572 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  26.74 
 
 		 565 aa  220  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30 
 
 		 567 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  34.49 
 
 		 567 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  26.43 
 
 		 565 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  31.3 
 
 		 551 aa  219  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  31.44 
 
 		 553 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  33.93 
 
 		 557 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  37.66 
 
 		 547 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  30.91 
 
 		 555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  30.58 
 
 		 553 aa  217  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  34.42 
 
 		 558 aa  216  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  30.84 
 
 		 569 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  34.25 
 
 		 561 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  31.3 
 
 		 574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 556 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  35.5 
 
 		 546 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 		 561 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  31.37 
 
 		 575 aa  212  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  35.74 
 
 		 529 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 561 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  29.21 
 
 		 555 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  29.02 
 
 		 555 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 561 aa  211  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  35.69 
 
 		 606 aa  210  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  35.34 
 
 		 606 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  32.97 
 
 		 557 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  34.38 
 
 		 570 aa  209  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  31.93 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  30.82 
 
 		 582 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  35.5 
 
 		 546 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 573 aa  209  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.96 
 
 		 557 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  26.12 
 
 		 574 aa  209  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  27.89 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  34.25 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  30 
 
 		 568 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  29.75 
 
 		 586 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  29.7 
 
 		 586 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  35.34 
 
 		 606 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 586 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  29.22 
 
 		 561 aa  207  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  30.1 
 
 		 553 aa  207  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  28.72 
 
 		 559 aa  207  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  30.12 
 
 		 553 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 549 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  31.37 
 
 		 559 aa  206  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  29.65 
 
 		 586 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  32.49 
 
 		 556 aa  206  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  32.4 
 
 		 557 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  31.71 
 
 		 557 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  29.51 
 
 		 562 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  29.44 
 
 		 579 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  31.95 
 
 		 543 aa  204  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  32.08 
 
 		 557 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  29.72 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  37.48 
 
 		 557 aa  204  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  29.76 
 
 		 579 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  32.08 
 
 		 557 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  33.11 
 
 		 601 aa  203  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  32.35 
 
 		 554 aa  203  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  28.57 
 
 		 557 aa  203  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  30.58 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  29.35 
 
 		 579 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  29.55 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 564 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  26.33 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  30.53 
 
 		 560 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  29.55 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  34.29 
 
 		 551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  33.68 
 
 		 557 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  29.62 
 
 		 579 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  32.78 
 
 		 572 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  31.08 
 
 		 559 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>