More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3138 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  57.62 
 
 
218 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  57.89 
 
 
214 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  55.67 
 
 
232 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1474  ABC transporter related  52.8 
 
 
250 aa  214  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  53.3 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3135  ABC transporter related  47.64 
 
 
242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  52.45 
 
 
242 aa  209  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  49.3 
 
 
273 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1324  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 
239 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1368  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 
239 aa  198  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  50.95 
 
 
277 aa  197  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2096  ABC transporter related  48.69 
 
 
221 aa  191  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.180446  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  48.15 
 
 
251 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3211  ABC cobalt transporter, ATPase subunit, CbiO  49.29 
 
 
254 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.58505  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3950  ABC transporter related  49.51 
 
 
254 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.6 
 
 
257 aa  175  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  45.28 
 
 
258 aa  175  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.08 
 
 
253 aa  174  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  41.31 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 
246 aa  168  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.76 
 
 
259 aa  168  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 
278 aa  166  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 
276 aa  165  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 
256 aa  165  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.29 
 
 
256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.64 
 
 
266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.27 
 
 
281 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.39 
 
 
398 aa  162  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.27 
 
 
411 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
249 aa  161  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 
281 aa  161  6e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 
403 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.65 
 
 
284 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
254 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
264 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.18 
 
 
252 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 
440 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  37.22 
 
 
380 aa  156  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.51 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  39.72 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  39.91 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  39.91 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 
243 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 
277 aa  154  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1349  ABC transporter related  43.43 
 
 
217 aa  154  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  hitchhiker  0.0000183126 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.75 
 
 
271 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  37.28 
 
 
255 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 
270 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.33 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.7 
 
 
254 aa  151  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
281 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  37.44 
 
 
278 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  38.21 
 
 
269 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 
395 aa  150  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.56 
 
 
250 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  40.09 
 
 
265 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  33.63 
 
 
283 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
249 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  39.15 
 
 
246 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1778  ABC transporter-like protein protein  42.45 
 
 
254 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.75 
 
 
277 aa  148  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.62 
 
 
276 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.32 
 
 
402 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  38.79 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  39.25 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 
453 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1753  ABC transporter-like  43.35 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0198415  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 
310 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 
270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2780  ABC transporter related  37.68 
 
 
244 aa  145  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.410215  decreased coverage  0.00175924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 
456 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 
270 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 
541 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.04 
 
 
277 aa  144  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  37.33 
 
 
282 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.96 
 
 
281 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  33.8 
 
 
240 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0540  cobalt import ATP-binding protein CbiO  39.67 
 
 
215 aa  141  9e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.36 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 
403 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  35.48 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.05 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0174  cobalt transport ATP-binding protein CbiO  38.46 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  35.51 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  35.19 
 
 
239 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.62 
 
 
286 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.57 
 
 
273 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
285 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.73 
 
 
274 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.05 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>