More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_30201 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  100 
 
 		 562 aa  1118    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  61.99 
 
 		 560 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  61.81 
 
 		 561 aa  618  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  50.18 
 
 		 568 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  42.53 
 
 		 561 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  42.53 
 
 		 561 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 575 aa  383  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  40.14 
 
 		 582 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  43.21 
 
 		 581 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  43.2 
 
 		 595 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  38.08 
 
 		 586 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  38.08 
 
 		 586 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  39.62 
 
 		 592 aa  331  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  38.85 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1805  DNA repair protein RecN, ABC transporter  33.21 
 
 		 559 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19221  DNA repair protein RecN, ABC transporter  32.28 
 
 		 559 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.589308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  31.97 
 
 		 559 aa  297  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19041  DNA repair protein RecN, ABC transporter  31.32 
 
 		 558 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0149908  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 559 aa  264  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  33.88 
 
 		 555 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  31.23 
 
 		 577 aa  247  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  35.1 
 
 		 549 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  35.1 
 
 		 549 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  35.1 
 
 		 549 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  34.8 
 
 		 549 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  30.96 
 
 		 555 aa  243  6e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  31.07 
 
 		 567 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  31.48 
 
 		 565 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.93 
 
 		 559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  34.92 
 
 		 549 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  29.53 
 
 		 573 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  32.63 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  30.69 
 
 		 573 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  32.57 
 
 		 554 aa  236  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 574 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  33.58 
 
 		 549 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  33.58 
 
 		 549 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  34.48 
 
 		 554 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  29 
 
 		 579 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 549 aa  233  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  30.52 
 
 		 566 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  29.72 
 
 		 562 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 567 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  30.85 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  28.47 
 
 		 579 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 		 579 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  34.73 
 
 		 554 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 		 579 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 		 579 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 		 558 aa  230  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 		 579 aa  230  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  34.73 
 
 		 554 aa  230  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  28.29 
 
 		 583 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.43 
 
 		 579 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  27.87 
 
 		 583 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  28.29 
 
 		 579 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  28.29 
 
 		 579 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 558 aa  227  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  30.71 
 
 		 580 aa  227  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 549 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3968  DNA repair protein RecN  34.71 
 
 		 556 aa  226  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.039947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.06 
 
 		 554 aa  226  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  29.8 
 
 		 570 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 555 aa  224  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 557 aa  224  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  32.64 
 
 		 563 aa  224  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  31.72 
 
 		 601 aa  224  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  29.01 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  32.51 
 
 		 560 aa  223  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  32.74 
 
 		 549 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  30.73 
 
 		 555 aa  223  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  28.86 
 
 		 557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  32.42 
 
 		 568 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  31.35 
 
 		 605 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 567 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2505  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 555 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 552 aa  221  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  32.64 
 
 		 557 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  30.92 
 
 		 578 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  33.7 
 
 		 573 aa  220  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 551 aa  220  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0450  DNA repair protein RecN  35.07 
 
 		 558 aa  219  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  29.53 
 
 		 561 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0611  DNA repair protein RecN  35.07 
 
 		 558 aa  219  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  32.79 
 
 		 569 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0730  DNA repair protein RecN  34.66 
 
 		 556 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.937093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  32.49 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  30.2 
 
 		 572 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.21 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.22 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 591 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  31.01 
 
 		 565 aa  217  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  30.93 
 
 		 608 aa  217  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>