More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0822 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0822  SMC protein-like protein  100 
 
 		 1100 aa  2086    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.866363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  39.51 
 
 		 1080 aa  462  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  27.24 
 
 		 1187 aa  342  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  24.73 
 
 		 1177 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  26.2 
 
 		 1189 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  26.32 
 
 		 1189 aa  304  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  24.28 
 
 		 1190 aa  303  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1199 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  30.56 
 
 		 1199 aa  302  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  30.3 
 
 		 1199 aa  299  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.43 
 
 		 1184 aa  292  2e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  37.69 
 
 		 1074 aa  283  9e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.78 
 
 		 1180 aa  283  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  27.76 
 
 		 1176 aa  283  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  26.82 
 
 		 1181 aa  283  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  25.51 
 
 		 1204 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  27.94 
 
 		 1167 aa  268  5.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  27.38 
 
 		 1176 aa  262  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.11 
 
 		 1186 aa  259  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  28.07 
 
 		 1174 aa  254  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.98 
 
 		 1185 aa  249  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  26.55 
 
 		 1196 aa  234  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  29.58 
 
 		 1134 aa  231  6e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  27.27 
 
 		 1190 aa  230  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.35 
 
 		 1170 aa  227  7e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  27.29 
 
 		 1189 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 		 1186 aa  222  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  26.49 
 
 		 1189 aa  221  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  27.3 
 
 		 1179 aa  219  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  26.52 
 
 		 1189 aa  218  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.03 
 
 		 1188 aa  213  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.03 
 
 		 1188 aa  213  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  23.86 
 
 		 1185 aa  211  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  23.63 
 
 		 1175 aa  209  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.82 
 
 		 1191 aa  208  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  26.05 
 
 		 1185 aa  207  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.92 
 
 		 1170 aa  207  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 		 1187 aa  205  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  26.75 
 
 		 1186 aa  205  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0156  p115 protein  21.31 
 
 		 981 aa  204  5e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.03 
 
 		 1171 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  23.91 
 
 		 1226 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  24.07 
 
 		 1226 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  21.97 
 
 		 1172 aa  199  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  31.63 
 
 		 1185 aa  199  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  27.75 
 
 		 1191 aa  196  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.79 
 
 		 1164 aa  195  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  26.53 
 
 		 1185 aa  192  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  28.91 
 
 		 1174 aa  190  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  23.35 
 
 		 1172 aa  189  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  25.4 
 
 		 1149 aa  189  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  28.69 
 
 		 1177 aa  188  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  23.61 
 
 		 1190 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.83 
 
 		 1193 aa  181  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  24.44 
 
 		 1219 aa  180  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  28.63 
 
 		 1301 aa  177  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  27.74 
 
 		 1175 aa  172  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.77 
 
 		 1177 aa  169  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  39.27 
 
 		 1142 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  22.65 
 
 		 1185 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  22.59 
 
 		 1185 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  39.27 
 
 		 1142 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 		 1308 aa  169  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  39.27 
 
 		 1142 aa  169  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  38.36 
 
 		 1145 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  38.36 
 
 		 1145 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  25.2 
 
 		 1082 aa  166  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  36.29 
 
 		 299 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  34.83 
 
 		 1144 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.86 
 
 		 1207 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  26.19 
 
 		 1179 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  37.9 
 
 		 1138 aa  163  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  31.19 
 
 		 1205 aa  162  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  37.9 
 
 		 1138 aa  161  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  37.9 
 
 		 1138 aa  161  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  37.9 
 
 		 1138 aa  161  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  37.9 
 
 		 1138 aa  161  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  26.91 
 
 		 1176 aa  161  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  39.52 
 
 		 1164 aa  161  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  35.52 
 
 		 1133 aa  160  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.14 
 
 		 1153 aa  157  8e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  34.01 
 
 		 1162 aa  157  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  37.61 
 
 		 1162 aa  157  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  37.44 
 
 		 1141 aa  156  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  36.99 
 
 		 1168 aa  156  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  34.34 
 
 		 1140 aa  156  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  38.53 
 
 		 1139 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  37.16 
 
 		 1162 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  37.16 
 
 		 1162 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  37.9 
 
 		 1195 aa  155  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  37.16 
 
 		 1162 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  36.86 
 
 		 1173 aa  155  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  33.45 
 
 		 1162 aa  154  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  32.53 
 
 		 1162 aa  154  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  35.35 
 
 		 1170 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  34.74 
 
 		 1206 aa  154  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  34.43 
 
 		 1170 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  34.43 
 
 		 1170 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  35.05 
 
 		 1268 aa  153  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  34.43 
 
 		 1170 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>