More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0781 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0781  SMC domain protein  100 
 
 		 514 aa  1019    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 556 aa  201  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  26.29 
 
 		 552 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  26.29 
 
 		 552 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  26.29 
 
 		 552 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  26.29 
 
 		 552 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  28.46 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  26.39 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  25.36 
 
 		 556 aa  186  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  23.69 
 
 		 573 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  27.54 
 
 		 565 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  25.76 
 
 		 553 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  23.54 
 
 		 547 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  28.35 
 
 		 580 aa  178  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  24.81 
 
 		 523 aa  177  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  23.78 
 
 		 589 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  23.58 
 
 		 576 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  26.08 
 
 		 558 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  25.54 
 
 		 552 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  25.71 
 
 		 552 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  22.85 
 
 		 549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  25.4 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  27.32 
 
 		 554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  25.54 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  25.09 
 
 		 554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  26.07 
 
 		 552 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  25.89 
 
 		 564 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  25.18 
 
 		 552 aa  174  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  24.78 
 
 		 553 aa  173  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  27.94 
 
 		 573 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  25.49 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  26.35 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  25.71 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  25.13 
 
 		 553 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  26.86 
 
 		 554 aa  169  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  23.55 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 		 562 aa  169  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  23.55 
 
 		 549 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  23.55 
 
 		 549 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  23.55 
 
 		 549 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  23.55 
 
 		 549 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  23.55 
 
 		 549 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  23.55 
 
 		 549 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  23.55 
 
 		 549 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  26.02 
 
 		 558 aa  167  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  24.5 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  23.68 
 
 		 586 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  23.27 
 
 		 549 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  24.64 
 
 		 553 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  24.32 
 
 		 553 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  24.32 
 
 		 553 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  26.23 
 
 		 559 aa  166  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  24.32 
 
 		 553 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  26.23 
 
 		 559 aa  166  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  26.34 
 
 		 554 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  24.32 
 
 		 553 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  24.82 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  24.82 
 
 		 553 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  25 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  24.6 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  25.09 
 
 		 557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  27.45 
 
 		 551 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  25.7 
 
 		 557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  24.64 
 
 		 557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  25.9 
 
 		 558 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  23.7 
 
 		 553 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  23.65 
 
 		 567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  26.38 
 
 		 558 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  24.82 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  24.82 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  24.82 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  23.96 
 
 		 549 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  23.96 
 
 		 549 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  24.82 
 
 		 553 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  24.82 
 
 		 553 aa  163  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  24.82 
 
 		 553 aa  163  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  23.96 
 
 		 549 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  25.37 
 
 		 554 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  27.4 
 
 		 565 aa  162  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  23.88 
 
 		 558 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  23.37 
 
 		 549 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  23.5 
 
 		 591 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  23.74 
 
 		 553 aa  161  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  24.09 
 
 		 549 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  24.86 
 
 		 555 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  24.67 
 
 		 552 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  25 
 
 		 557 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  23.84 
 
 		 557 aa  160  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  24.51 
 
 		 555 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  21.28 
 
 		 557 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  24.77 
 
 		 558 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  27.07 
 
 		 559 aa  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  23.41 
 
 		 549 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  24.11 
 
 		 553 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  28.62 
 
 		 567 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  24.11 
 
 		 553 aa  158  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  24.11 
 
 		 553 aa  158  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  25.35 
 
 		 574 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  24.73 
 
 		 556 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>