35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1887 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  342  2e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0505  syntaxin domain-containing protein  75.16 
 
 
147 aa  209  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0474  syntaxin domain-containing protein  67.46 
 
 
133 aa  204  6e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00702361  hitchhiker  0.0000000254613 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  70.51 
 
 
140 aa  190  7e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0520  hypothetical protein  55.88 
 
 
137 aa  156  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0226717  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1513  paREP15, putative coiled-coil protein  57.05 
 
 
115 aa  138  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.086591  normal  0.573379 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  36.26 
 
 
194 aa  102  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0121  paREP15, putative coiled-coil protein  50.96 
 
 
111 aa  100  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0876  paREP15, putative coiled-coil protein  40.29 
 
 
150 aa  85.5  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  33.95 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0490  paREP15, putative coiled-coil protein  35.96 
 
 
123 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.765931 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  33.63 
 
 
328 aa  54.3  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  35.71 
 
 
177 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N30  BdrR  30.83 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC60  BdrE  28.57 
 
 
210 aa  51.2  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000600085  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1031  hypothetical protein  28.21 
 
 
183 aa  48.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.413291  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  27.03 
 
 
212 aa  47.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05450  hypothetical protein  28.12 
 
 
349 aa  47.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0138  virulence factor Mce family protein  32.8 
 
 
381 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC21  BdrE  29.09 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  22.12 
 
 
1621 aa  44.7  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R27  BdrP  26.13 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000894815  n/a   
 
 
-
 
NC_011735  BbuZS7_X34  BdrM  28.18 
 
 
197 aa  42.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0076991  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1710  hypothetical protein  22 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.150562  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1691  hypothetical protein  22 
 
 
146 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC14  repeat motif-containing protein  26.72 
 
 
213 aa  42  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.577398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  31.08 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3513  hypothetical protein  37.68 
 
 
113 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000049357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  27.64 
 
 
207 aa  42  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  24.29 
 
 
638 aa  41.6  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3254  hypothetical protein  28.85 
 
 
133 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000011142  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  29.27 
 
 
242 aa  41.2  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0500  hypothetical protein  30.49 
 
 
619 aa  41.2  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.892489  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  28.35 
 
 
745 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10605  MCE family lipoprotein LprL  31.15 
 
 
402 aa  40.8  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.961449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>