37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0876 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0876  paREP15, putative coiled-coil protein  100 
 
 
150 aa  288  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  52.74 
 
 
194 aa  143  7.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  40.29 
 
 
172 aa  85.5  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  53.75 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  33.14 
 
 
205 aa  77.4  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0505  syntaxin domain-containing protein  42.11 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0520  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0226717  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0474  syntaxin domain-containing protein  45.56 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00702361  hitchhiker  0.0000000254613 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1513  paREP15, putative coiled-coil protein  52.63 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.086591  normal  0.573379 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  33.86 
 
 
328 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0121  paREP15, putative coiled-coil protein  50 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  30.17 
 
 
278 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0132  hypothetical protein  34.65 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  33.33 
 
 
1333 aa  47.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N30  BdrR  34.57 
 
 
184 aa  47  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC60  BdrE  30.39 
 
 
210 aa  46.2  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000600085  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04499  Nuclear pore complex protein An-Nsp1 (Eurofung)  24.84 
 
 
624 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.041249 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  29.46 
 
 
212 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 
1239 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  37.14 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  26.28 
 
 
567 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 
2052 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011735  BbuZS7_X34  BdrM  33.64 
 
 
197 aa  43.5  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0076991  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC21  BdrE  28.26 
 
 
196 aa  43.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0617  hypothetical protein  24.84 
 
 
226 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.492305  normal  0.391566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  29.69 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  36.23 
 
 
694 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.66 
 
 
997 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  24.19 
 
 
229 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1052  low-affinity inorganic phosphate transporter  29.13 
 
 
489 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0869  BdrR  42.03 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2541  hypothetical protein  28.87 
 
 
381 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.231668  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1359  hypothetical protein  31.4 
 
 
242 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.03 
 
 
831 aa  40.8  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  29.46 
 
 
187 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0521  hypothetical protein  32.35 
 
 
179 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  27.59 
 
 
1621 aa  40  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>