19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0474 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0474  syntaxin domain-containing protein  100 
 
 
133 aa  263  7e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00702361  hitchhiker  0.0000000254613 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  71.6 
 
 
172 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  80.15 
 
 
140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1513  paREP15, putative coiled-coil protein  83.33 
 
 
115 aa  181  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.086591  normal  0.573379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0505  syntaxin domain-containing protein  66.67 
 
 
147 aa  166  8e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0520  hypothetical protein  61.19 
 
 
137 aa  144  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0226717  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0121  paREP15, putative coiled-coil protein  53.1 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  33.53 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0876  paREP15, putative coiled-coil protein  45.56 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  36.79 
 
 
205 aa  67  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0490  paREP15, putative coiled-coil protein  37.04 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R27  BdrP  31.08 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000894815  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  41.67 
 
 
187 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N30  BdrR  33.33 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC21  BdrE  33.33 
 
 
196 aa  41.2  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC14  repeat motif-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  40.8  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.577398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  33.8 
 
 
212 aa  40.8  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  27.34 
 
 
745 aa  40  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>