11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0490 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0490  paREP15, putative coiled-coil protein  100 
 
 		 123 aa  238  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0474  syntaxin domain-containing protein  37.04 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00702361  hitchhiker  0.0000000254613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0121  paREP15, putative coiled-coil protein  38.53 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  38.38 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0505  syntaxin domain-containing protein  34.92 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  35.96 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1513  paREP15, putative coiled-coil protein  35.77 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.086591  normal  0.573379 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0520  hypothetical protein  39 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0226717  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  27.43 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  27.68 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1817  hypothetical protein  22.94 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.820651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>