13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1031 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1031  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  353  1e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.413291  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1817  hypothetical protein  42.11 
 
 
231 aa  160  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.820651  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1021  hypothetical protein  37.78 
 
 
277 aa  153  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.130845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2329  conserved hypothetical protein  39.9 
 
 
227 aa  139  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000461934  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2553  conserved hypothetical protein  34.68 
 
 
152 aa  87  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0019  repeated sequence found in lipoprotein LPP  29.25 
 
 
540 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  29.38 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1514  hypothetical protein  32.84 
 
 
334 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000401583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  28.8 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  22.22 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  28.1 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  28.21 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  25 
 
 
485 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>