23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3254 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3254  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  262  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000011142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3256  kid repeat protein  47.37 
 
 
100 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000812616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3255  hypothetical protein  47.93 
 
 
96 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000708986  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC14  repeat motif-containing protein  39.64 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.577398  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC21  BdrE  46.15 
 
 
196 aa  63.2  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N30  BdrR  39.45 
 
 
184 aa  61.6  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P30  repeat motif-containing protein  46.84 
 
 
209 aa  61.6  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0212015  n/a   
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R27  BdrP  47.37 
 
 
177 aa  60.8  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000894815  n/a   
 
 
-
 
NC_011779  BbuZS7_G34  BdrW  42.53 
 
 
248 aa  60.5  0.000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  40.74 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC60  BdrE  35.64 
 
 
210 aa  52.4  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000600085  n/a   
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P37  BdrA  33.61 
 
 
228 aa  52.4  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  38.27 
 
 
229 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_011735  BbuZS7_X34  BdrM  35.56 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0076991  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0132  hypothetical protein  34.18 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0521  hypothetical protein  42.86 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H16  repeat motif-containing protein  40.24 
 
 
204 aa  45.8  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.785411  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3854  hypothetical protein  29.03 
 
 
218 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  28.85 
 
 
172 aa  41.2  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3903  hypothetical protein  29.03 
 
 
218 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0616  paREP15, putative coiled-coil protein  29.47 
 
 
205 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1460  syntaxin domain-containing protein  25.74 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.681361  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  28.7 
 
 
1153 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>