65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2524 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2524  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  881    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2261  hypothetical protein  48.15 
 
 
266 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000562988 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2467  hypothetical protein  32.12 
 
 
1037 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0481  YhgE/Pip N-terminal domain protein  32.29 
 
 
782 aa  106  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1210  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.46 
 
 
769 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  25.16 
 
 
915 aa  95.9  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  32.21 
 
 
1111 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0653  YhgE/Pip N-terminal domain protein  28.93 
 
 
797 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000732474  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3321  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
733 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156979  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  29.26 
 
 
1114 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5011  hypothetical protein  27.08 
 
 
666 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1081  hypothetical protein  25.3 
 
 
869 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1160  hypothetical protein  23.81 
 
 
869 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1009  hypothetical protein  25.3 
 
 
869 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0996  ABC-2 type transporter  26.3 
 
 
825 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1178  hypothetical protein  35.37 
 
 
911 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3037  YhgE/Pip N-terminal domain protein  31.16 
 
 
732 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0996  hypothetical protein  23.64 
 
 
869 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  24.7 
 
 
767 aa  72.8  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  35.75 
 
 
1246 aa  71.6  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4900  hypothetical protein  27.44 
 
 
666 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5619  hypothetical protein  25.99 
 
 
666 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000614153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0609  hypothetical protein  27.32 
 
 
772 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  36.73 
 
 
924 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  36.05 
 
 
923 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4913  hypothetical protein  26.01 
 
 
663 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.481222  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0820  hypothetical protein  23.03 
 
 
863 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22290  predicted membrane protein  28.29 
 
 
819 aa  66.6  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5340  hypothetical protein  26.54 
 
 
666 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5309  hypothetical protein  25.94 
 
 
666 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36196e-18 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4995  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 
669 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0951558  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02050  YhgE/Pip-like protein  28.05 
 
 
988 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0560  YhgE/Pip C-terminal domain protein  28.62 
 
 
692 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000430326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5390  hypothetical protein  25.69 
 
 
512 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5068  hypothetical protein  25.69 
 
 
666 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  29.1 
 
 
1068 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5453  hypothetical protein  25.69 
 
 
666 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5739  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  31.36 
 
 
683 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.979212 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0687  YhgE/Pip C-terminal domain protein  27.73 
 
 
946 aa  63.9  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15730  YhgE/Pip-like protein  28.66 
 
 
882 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1516  membrane protein-like protein  26.41 
 
 
759 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140138  hitchhiker  0.00312408 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  23.52 
 
 
623 aa  60.5  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5334  hypothetical protein  25.32 
 
 
666 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0082  YhgE/Pip C-terminal domain protein  33.91 
 
 
785 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32380  YhgE/Pip-like protein  30.86 
 
 
695 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1944  hypothetical protein  24.83 
 
 
721 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1632  membrane protein-like protein  29.32 
 
 
955 aa  56.6  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000847897  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0814  hypothetical protein  22.08 
 
 
1002 aa  56.6  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0663  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 
678 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2134  hypothetical protein  24.17 
 
 
772 aa  53.9  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00916626  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2215  YhgE/Pip C-terminal domain protein  42.17 
 
 
857 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.177228  normal  0.275037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0761  YhgE/Pip N-terminal domain protein  30.34 
 
 
711 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1960  YhgE/Pip C-terminal domain protein  23.98 
 
 
737 aa  53.5  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.779213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0811  YhgE/Pip C-terminal domain protein  32.75 
 
 
678 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3217  YhgE/Pip N-terminal domain protein  43.3 
 
 
740 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0017826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  26.14 
 
 
1040 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1752  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 
669 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5526  YhgE/Pip C-terminal domain protein  31 
 
 
631 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0273  membrane protein-like protein  33.5 
 
 
982 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3327  YhgE/Pip N-terminal domain-containing protein  29.34 
 
 
649 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0644816  normal  0.846988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3277  hypothetical protein  23.67 
 
 
217 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  28.05 
 
 
1092 aa  44.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1908  membrane protein-like protein  24.91 
 
 
642 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  24.78 
 
 
888 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0160  hypothetical protein  41.1 
 
 
630 aa  43.5  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>