241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1480 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  48.46 
 
 		 695 aa  664    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  54.16 
 
 		 692 aa  746    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1480  hypothetical protein  100 
 
 		 701 aa  1418    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0156637  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  43.22 
 
 		 684 aa  566  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1709  hypothetical protein  31.73 
 
 		 688 aa  325  2e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2396  hypothetical protein  31.89 
 
 		 724 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.92908 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  32.15 
 
 		 685 aa  308  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0159  hypothetical protein  28.4 
 
 		 706 aa  294  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  26.75 
 
 		 723 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  22.91 
 
 		 699 aa  84.7  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  23.35 
 
 		 860 aa  84.3  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  21.38 
 
 		 747 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  21.67 
 
 		 829 aa  80.5  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  21.67 
 
 		 829 aa  80.5  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  21.43 
 
 		 730 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  21.56 
 
 		 753 aa  75.5  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  19.71 
 
 		 713 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  24.21 
 
 		 974 aa  75.5  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  23.47 
 
 		 981 aa  73.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  22.98 
 
 		 1062 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  22.98 
 
 		 1062 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  22.89 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  22.49 
 
 		 1077 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  22.49 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  20.36 
 
 		 1001 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  20.96 
 
 		 968 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.54 
 
 		 764 aa  70.1  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  24.23 
 
 		 748 aa  69.3  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  24.46 
 
 		 974 aa  67.4  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  22.16 
 
 		 964 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  23.73 
 
 		 893 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  23.31 
 
 		 864 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  23.26 
 
 		 709 aa  64.7  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  22.96 
 
 		 752 aa  64.3  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  22.57 
 
 		 775 aa  63.9  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  20.95 
 
 		 713 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  19.88 
 
 		 385 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  23.17 
 
 		 758 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  19.88 
 
 		 385 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  21.32 
 
 		 737 aa  62  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  24.26 
 
 		 1146 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  23.8 
 
 		 743 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  23.49 
 
 		 743 aa  60.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  24.78 
 
 		 743 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  23.26 
 
 		 729 aa  60.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  23.49 
 
 		 743 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  18.36 
 
 		 385 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  24.05 
 
 		 893 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  23.49 
 
 		 743 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  21.42 
 
 		 712 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  19.78 
 
 		 779 aa  60.1  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  23.22 
 
 		 959 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  20.88 
 
 		 869 aa  60.1  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  22.32 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  24.92 
 
 		 1013 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  23.04 
 
 		 674 aa  58.9  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  28.36 
 
 		 872 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  23.31 
 
 		 1359 aa  58.9  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  21.76 
 
 		 967 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  20.78 
 
 		 699 aa  58.9  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  23.2 
 
 		 743 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  21.78 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  26.28 
 
 		 743 aa  58.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  22.89 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  23.3 
 
 		 813 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  26.32 
 
 		 945 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  26.32 
 
 		 945 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  22.55 
 
 		 743 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.33 
 
 		 812 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  22.89 
 
 		 743 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  21.7 
 
 		 962 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  23.96 
 
 		 955 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  25.15 
 
 		 704 aa  56.6  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  23.8 
 
 		 743 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  23.96 
 
 		 955 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  22.92 
 
 		 963 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  23.96 
 
 		 955 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  26.75 
 
 		 723 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  21.95 
 
 		 743 aa  56.2  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  21.84 
 
 		 796 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  22.13 
 
 		 749 aa  56.6  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  23.97 
 
 		 1013 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  24.86 
 
 		 740 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  20.44 
 
 		 702 aa  55.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1450  hypothetical protein  21.46 
 
 		 863 aa  55.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  22.04 
 
 		 674 aa  55.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  22.45 
 
 		 745 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.51 
 
 		 831 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  22.51 
 
 		 701 aa  55.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  25.48 
 
 		 934 aa  55.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  25.08 
 
 		 1002 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  22.91 
 
 		 1109 aa  54.7  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  23.05 
 
 		 717 aa  54.7  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  22.11 
 
 		 697 aa  54.3  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  22.11 
 
 		 920 aa  54.3  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  25.15 
 
 		 747 aa  53.9  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  23.58 
 
 		 731 aa  53.9  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  21.82 
 
 		 682 aa  53.9  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  21.77 
 
 		 941 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  32.81 
 
 		 958 aa  53.9  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>