140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2396 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2396  hypothetical protein  100 
 
 
724 aa  1442    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.92908 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1709  hypothetical protein  43 
 
 
688 aa  556  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0159  hypothetical protein  41.12 
 
 
706 aa  467  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1480  hypothetical protein  32.08 
 
 
701 aa  347  4e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0156637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  29.86 
 
 
692 aa  323  5e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  29.98 
 
 
695 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  28.83 
 
 
684 aa  292  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  29.18 
 
 
685 aa  242  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  25.1 
 
 
712 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  28.23 
 
 
682 aa  78.2  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  22.92 
 
 
704 aa  73.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  23.99 
 
 
730 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  24.94 
 
 
699 aa  64.7  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  25.44 
 
 
713 aa  64.7  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  23.5 
 
 
385 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  21.14 
 
 
829 aa  62  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  21.14 
 
 
829 aa  62  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  24.87 
 
 
967 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  23.76 
 
 
385 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  26.72 
 
 
882 aa  58.9  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  32.2 
 
 
733 aa  58.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  35.96 
 
 
380 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  30.3 
 
 
731 aa  58.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  26.19 
 
 
1001 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  23.12 
 
 
745 aa  57.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  33.04 
 
 
812 aa  57.4  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  26.27 
 
 
1013 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  22.14 
 
 
385 aa  57  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  26.05 
 
 
968 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  25.98 
 
 
777 aa  56.6  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  28.57 
 
 
746 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  28.32 
 
 
737 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  29.52 
 
 
753 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  26.83 
 
 
752 aa  55.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  23.34 
 
 
741 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  23.62 
 
 
388 aa  55.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  27.43 
 
 
738 aa  55.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  23.85 
 
 
743 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  21.6 
 
 
1359 aa  53.9  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  23.56 
 
 
743 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  23.56 
 
 
743 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  23.56 
 
 
743 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  23.64 
 
 
713 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  29.2 
 
 
762 aa  53.5  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  24.64 
 
 
748 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  23.57 
 
 
779 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  21.64 
 
 
893 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  28.9 
 
 
1011 aa  52.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.85 
 
 
1045 aa  52.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  25.27 
 
 
699 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  27.62 
 
 
923 aa  52.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  19.9 
 
 
730 aa  52  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  19.9 
 
 
730 aa  52  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  24.9 
 
 
723 aa  52  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  22.99 
 
 
743 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  19.9 
 
 
730 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  27.59 
 
 
810 aa  51.6  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  19.9 
 
 
730 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  27.93 
 
 
747 aa  51.6  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  19.9 
 
 
730 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  22.41 
 
 
743 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  23.38 
 
 
741 aa  51.2  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  28.23 
 
 
778 aa  51.2  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  26.97 
 
 
1068 aa  50.8  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  22.65 
 
 
730 aa  50.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  27.98 
 
 
805 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  27.67 
 
 
1146 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  19.66 
 
 
730 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  22.41 
 
 
743 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  19.51 
 
 
730 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  27.59 
 
 
832 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  22.72 
 
 
740 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  23.7 
 
 
893 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  25.42 
 
 
974 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  24.87 
 
 
1054 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  25.78 
 
 
1028 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.81 
 
 
697 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  24.43 
 
 
1040 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  24.07 
 
 
681 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  23.42 
 
 
777 aa  50.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  23.53 
 
 
934 aa  50.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 
1263 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  21.55 
 
 
743 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  19.42 
 
 
730 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  21.14 
 
 
740 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  19.42 
 
 
730 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  30.21 
 
 
758 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  23.47 
 
 
758 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  30.54 
 
 
712 aa  48.9  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  23.28 
 
 
743 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  24.05 
 
 
761 aa  48.5  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  24.2 
 
 
962 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  24.84 
 
 
874 aa  48.5  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  24.71 
 
 
732 aa  48.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.74 
 
 
1226 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  26.75 
 
 
674 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.59 
 
 
812 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  25.89 
 
 
358 aa  47.4  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  27.45 
 
 
743 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  26.75 
 
 
674 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>