More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4317 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1263 aa  2476    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  38.19 
 
 
1074 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  39.11 
 
 
1067 aa  469  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  39.59 
 
 
1064 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  37.94 
 
 
1016 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  38.81 
 
 
1089 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 
1038 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  37.3 
 
 
1038 aa  439  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  37.3 
 
 
1038 aa  439  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  37.17 
 
 
1038 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  37.42 
 
 
1038 aa  440  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  37.3 
 
 
1038 aa  439  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  39.72 
 
 
1104 aa  439  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  37.17 
 
 
1038 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  37.3 
 
 
1038 aa  439  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  37.17 
 
 
1038 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  37.43 
 
 
1015 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  37.72 
 
 
1028 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  37.55 
 
 
1039 aa  436  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  38.9 
 
 
1065 aa  436  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  39.52 
 
 
1062 aa  429  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  38.35 
 
 
1089 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  37.31 
 
 
1075 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  37.69 
 
 
1039 aa  426  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  36.38 
 
 
1014 aa  426  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  40.9 
 
 
1097 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  38.29 
 
 
1121 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  35.03 
 
 
1004 aa  419  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  36.75 
 
 
1072 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 
1050 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  38.87 
 
 
1040 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 
1034 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  36.15 
 
 
980 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  38.14 
 
 
1077 aa  402  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  36.88 
 
 
1014 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  36.41 
 
 
955 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.41 
 
 
1014 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  36.54 
 
 
1014 aa  396  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  36.9 
 
 
1014 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.41 
 
 
1014 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  35.08 
 
 
1055 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  35.08 
 
 
1055 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  36.04 
 
 
1014 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.78 
 
 
1051 aa  390  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.11 
 
 
1014 aa  383  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  33.42 
 
 
1023 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  38.55 
 
 
1028 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 
1011 aa  373  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 
1044 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 
1043 aa  362  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 
1040 aa  360  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  33.76 
 
 
1043 aa  351  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 
1034 aa  348  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 
1054 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 
1173 aa  345  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 
1044 aa  345  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 
1054 aa  343  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 
1055 aa  340  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 
1038 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 
1070 aa  338  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  32.68 
 
 
1036 aa  337  7e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 
1054 aa  337  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 
1067 aa  336  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 
1046 aa  336  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.47 
 
 
1081 aa  335  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 
1028 aa  334  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 
1086 aa  332  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 
1028 aa  331  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 
1041 aa  327  8.000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 
1041 aa  327  9e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 
1095 aa  327  9e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 
1039 aa  325  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 
1039 aa  324  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  29.7 
 
 
1050 aa  323  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 
1059 aa  322  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 
1102 aa  321  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 
1033 aa  321  7e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 
1032 aa  320  9e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 
1026 aa  320  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 
1034 aa  320  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 
1022 aa  317  8e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 
1063 aa  317  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 
1071 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 
1085 aa  313  9e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 
1075 aa  313  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  31.76 
 
 
1087 aa  311  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 
1053 aa  311  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 
1085 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 
1041 aa  311  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 
1085 aa  311  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 
1046 aa  311  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 
1085 aa  310  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 
1087 aa  310  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 
1087 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 
1083 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 
1087 aa  310  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 
1027 aa  309  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.16 
 
 
1065 aa  308  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 
1051 aa  308  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 
1031 aa  308  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>