More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1703 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 		 1044 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  53.84 
 
 		 1122 aa  1108    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  82.05 
 
 		 1082 aa  1748    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  94.4 
 
 		 1091 aa  2026    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  94.29 
 
 		 1085 aa  2006    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  92.17 
 
 		 1083 aa  1963    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  36.23 
 
 		 1043 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  37.27 
 
 		 1043 aa  637    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  35.98 
 
 		 1050 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  83.41 
 
 		 1086 aa  1798    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  81.48 
 
 		 1102 aa  1768    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  94.11 
 
 		 1085 aa  2004    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  78.53 
 
 		 1095 aa  1672    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  94.29 
 
 		 1085 aa  2008    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  46.02 
 
 		 1173 aa  919    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  54.08 
 
 		 1156 aa  1106    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  83.72 
 
 		 1087 aa  1767    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2529  acriflavin resistance protein  42.97 
 
 		 1213 aa  736    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  98.9 
 
 		 1087 aa  2164    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  98.62 
 
 		 1087 aa  2157    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  81.05 
 
 		 1083 aa  1751    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  94.01 
 
 		 1085 aa  2003    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1087 aa  2187    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  79.26 
 
 		 1081 aa  1691    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  43.14 
 
 		 1166 aa  762    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1034 aa  633  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  35.13 
 
 		 1040 aa  624  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  36.62 
 
 		 1044 aa  622  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  37.03 
 
 		 1027 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 		 1024 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  33.64 
 
 		 1046 aa  565  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  34.7 
 
 		 1017 aa  561  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  35.46 
 
 		 1027 aa  539  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1044 aa  534  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.61 
 
 		 1055 aa  531  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1038 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1038 aa  522  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1028 aa  513  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 		 1058 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.91 
 
 		 1024 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1050 aa  501  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.63 
 
 		 1049 aa  494  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1071 aa  496  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1041 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1032 aa  493  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1470 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  31.03 
 
 		 1496 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1041 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1039 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30.09 
 
 		 1036 aa  474  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1069 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1070 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1053 aa  473  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1041 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1070 aa  462  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1039 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1095 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.63 
 
 		 1024 aa  459  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1087 aa  459  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1101 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1051 aa  458  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1028 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 		 1044 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1038 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  30.15 
 
 		 1069 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1022 aa  449  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  31.02 
 
 		 1040 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  30 
 
 		 1048 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1026 aa  446  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1079 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1033 aa  442  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1065 aa  439  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 		 1063 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1048 aa  439  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1171 aa  436  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.44 
 
 		 1031 aa  435  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1034 aa  436  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1075 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  33.03 
 
 		 1084 aa  436  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 		 1029 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1014 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1030 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1046 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  29.56 
 
 		 1092 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3520  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 		 1061 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2586  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 		 1061 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.71 
 
 		 1034 aa  432  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 		 1177 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1037 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1059 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1058 aa  428  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.99 
 
 		 1031 aa  426  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1031 aa  425  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1066 aa  426  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 		 1058 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  27.71 
 
 		 1030 aa  425  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.09 
 
 		 1068 aa  426  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1031 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1037 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1055 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>