More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1882 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  92.73 
 
 		 1031 aa  1917    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  37.06 
 
 		 1036 aa  658    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  38.04 
 
 		 1032 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  38.68 
 
 		 1050 aa  677    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  37.51 
 
 		 1014 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  37.34 
 
 		 1014 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  93.11 
 
 		 1031 aa  1932    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.7 
 
 		 1024 aa  904    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  45.61 
 
 		 1046 aa  867    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  38.2 
 
 		 1044 aa  696    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  55.69 
 
 		 1029 aa  1129    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.8 
 
 		 1043 aa  691    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  37.23 
 
 		 1029 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1031 aa  2068    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.2 
 
 		 1046 aa  876    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  37.92 
 
 		 1034 aa  670    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  42.53 
 
 		 1025 aa  746    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1015 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  35.99 
 
 		 1015 aa  643    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  46.22 
 
 		 1037 aa  917    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 		 1048 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  51.84 
 
 		 1048 aa  1028    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  37.41 
 
 		 1026 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  46.2 
 
 		 1047 aa  873    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.91 
 
 		 1057 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  82.14 
 
 		 1030 aa  1761    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  47.46 
 
 		 1045 aa  891    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  36.96 
 
 		 1019 aa  659    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  35.82 
 
 		 1025 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  92.82 
 
 		 1031 aa  1925    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  38.1 
 
 		 1009 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  38.58 
 
 		 1048 aa  643    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  46.1 
 
 		 1047 aa  874    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  92.82 
 
 		 1031 aa  1925    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  82.74 
 
 		 1034 aa  1760    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  54.24 
 
 		 1052 aa  1058    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  46.2 
 
 		 1047 aa  874    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  45.48 
 
 		 1024 aa  818    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  42.07 
 
 		 1064 aa  783    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  37.49 
 
 		 1032 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  53.28 
 
 		 1028 aa  1095    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  41.94 
 
 		 1048 aa  745    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  46.09 
 
 		 1036 aa  882    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  56.81 
 
 		 1035 aa  1183    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  45.35 
 
 		 1037 aa  884    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  37.59 
 
 		 1029 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  46.02 
 
 		 1035 aa  893    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  49.27 
 
 		 1038 aa  919    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  45.83 
 
 		 1036 aa  898    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3649  acriflavin resistance protein  37.37 
 
 		 1035 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  60.31 
 
 		 1046 aa  1284    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1651  acriflavin resistance protein  37.61 
 
 		 1026 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  38.13 
 
 		 1049 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  83.61 
 
 		 1042 aa  1760    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  41.6 
 
 		 1040 aa  709    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  46.2 
 
 		 1047 aa  873    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  42.39 
 
 		 1051 aa  780    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  81.67 
 
 		 1031 aa  1682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  37.72 
 
 		 1034 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  93.02 
 
 		 1031 aa  1930    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  52.6 
 
 		 1041 aa  991    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  46.96 
 
 		 1042 aa  880    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  58.39 
 
 		 1035 aa  1208    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2699  acriflavin resistance protein  38.17 
 
 		 1029 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  37.66 
 
 		 1029 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  36.32 
 
 		 1012 aa  651    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  56.37 
 
 		 1036 aa  1153    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  39.96 
 
 		 1051 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  39.75 
 
 		 1040 aa  703    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  38.98 
 
 		 1026 aa  727    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  37.36 
 
 		 1030 aa  692    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  36.51 
 
 		 1012 aa  656    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.33 
 
 		 1068 aa  805    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  46.3 
 
 		 1051 aa  869    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  96.8 
 
 		 1031 aa  2001    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  37.67 
 
 		 1017 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  46.3 
 
 		 1051 aa  872    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  96.9 
 
 		 1031 aa  2002    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  45.28 
 
 		 1022 aa  883    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  49.56 
 
 		 1036 aa  957    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  46.5 
 
 		 1034 aa  921    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  37.92 
 
 		 1029 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  49.56 
 
 		 1040 aa  988    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  37.41 
 
 		 1044 aa  670    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  36.68 
 
 		 1028 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  36.17 
 
 		 1040 aa  642    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  36.76 
 
 		 1019 aa  657    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  39.34 
 
 		 1018 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  51.55 
 
 		 1041 aa  1000    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  38.69 
 
 		 1018 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  37.15 
 
 		 1040 aa  656    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  44.33 
 
 		 1023 aa  817    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  46.3 
 
 		 1051 aa  868    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  96.7 
 
 		 1031 aa  2000    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.8 
 
 		 1043 aa  690    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  47.09 
 
 		 1035 aa  900    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  37.41 
 
 		 1014 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  82.12 
 
 		 1034 aa  1734    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  37.54 
 
 		 1014 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  83.17 
 
 		 1031 aa  1771    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>