More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0652 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  48.15 
 
 
1028 aa  864    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  64.2 
 
 
1017 aa  1217    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  40.23 
 
 
1043 aa  672    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  36.34 
 
 
1044 aa  681    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  34.64 
 
 
1034 aa  649    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  38.38 
 
 
1050 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  51.51 
 
 
1024 aa  918    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  55.4 
 
 
1027 aa  993    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  38.09 
 
 
1011 aa  717    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1027 aa  1997    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  36.88 
 
 
1034 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  47.31 
 
 
1026 aa  847    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  36.3 
 
 
1044 aa  635  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  36.02 
 
 
1040 aa  625  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 
1043 aa  618  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.91 
 
 
1049 aa  603  1.0000000000000001e-171  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.43 
 
 
1091 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36 
 
 
1081 aa  589  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  35.46 
 
 
1086 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  34.63 
 
 
1083 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  35.46 
 
 
1087 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 
1087 aa  582  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 
1087 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 
1082 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.11 
 
 
1024 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 
1102 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  33.98 
 
 
1046 aa  570  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 
1044 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 
1470 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 
1023 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 
1038 aa  551  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.72 
 
 
1122 aa  545  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 
1039 aa  545  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  34.7 
 
 
1055 aa  534  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 
1029 aa  536  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 
1071 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  33.36 
 
 
1069 aa  527  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 
1041 aa  528  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  32.04 
 
 
1496 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 
1039 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 
1038 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 
1034 aa  526  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  34.68 
 
 
1028 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 
1095 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  32.48 
 
 
1009 aa  522  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  35.08 
 
 
1028 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 
1041 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  36.11 
 
 
1045 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 
1032 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 
1041 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 
1050 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 
1036 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  36.79 
 
 
1044 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 
1041 aa  515  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 
1058 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 
1065 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 
1070 aa  510  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  35.42 
 
 
1038 aa  509  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 
1048 aa  505  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 
1028 aa  503  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 
1058 aa  503  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 
1063 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 
1047 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 
1058 aa  497  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 
1075 aa  496  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  31.79 
 
 
1036 aa  488  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 
1026 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 
1006 aa  489  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 
1014 aa  488  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.95 
 
 
1024 aa  486  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 
1030 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 
1053 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 
1066 aa  486  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  34.46 
 
 
1031 aa  485  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 
1051 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 
1040 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 
1046 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 
1022 aa  475  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  29.41 
 
 
1026 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 
1031 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 
1034 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 
1059 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  29.94 
 
 
1050 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.68 
 
 
1034 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 
1037 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 
1067 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 
1042 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 
1028 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 
1037 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 
1054 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 
1035 aa  465  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  30.48 
 
 
1035 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 
1054 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 
1031 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 
1031 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 
1031 aa  463  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 
1033 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 
1054 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.91 
 
 
1031 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 
1036 aa  462  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>