More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2099 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  39.46 
 
 
1017 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.72 
 
 
1091 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  35.84 
 
 
1086 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  44.26 
 
 
1044 aa  881    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  37.33 
 
 
1085 aa  651    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  35.91 
 
 
1082 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.66 
 
 
1024 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  45.5 
 
 
1050 aa  912    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  40.65 
 
 
1034 aa  777    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  37.18 
 
 
1055 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  40.37 
 
 
1027 aa  669    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  40.66 
 
 
1043 aa  797    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  37.33 
 
 
1085 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  36.77 
 
 
1038 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  39.6 
 
 
1040 aa  741    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  37.29 
 
 
1087 aa  648    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  37.03 
 
 
1083 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 
1087 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  39.85 
 
 
1027 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  43.82 
 
 
1044 aa  902    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  46.15 
 
 
1034 aa  934    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  44.14 
 
 
1011 aa  895    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1043 aa  2048    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  37.27 
 
 
1087 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.05 
 
 
1081 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  37.33 
 
 
1085 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  36.94 
 
 
1085 aa  651    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  39.09 
 
 
1026 aa  632  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  35.97 
 
 
1095 aa  625  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 
1083 aa  627  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  36.33 
 
 
1039 aa  626  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  35.33 
 
 
1102 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.98 
 
 
1049 aa  622  1e-177  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  34 
 
 
1058 aa  625  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  34.83 
 
 
1058 aa  622  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  35.87 
 
 
1087 aa  618  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  34.91 
 
 
1041 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  34.05 
 
 
1173 aa  614  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  35.42 
 
 
1046 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  37.43 
 
 
1024 aa  612  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  34.69 
 
 
1023 aa  612  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  34.69 
 
 
1071 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 
1470 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  34.8 
 
 
1496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 
1058 aa  605  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  34.43 
 
 
1036 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.78 
 
 
1122 aa  602  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 
1034 aa  598  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 
1063 aa  598  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 
1032 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 
1053 aa  595  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  39.14 
 
 
1028 aa  595  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  35.38 
 
 
1069 aa  593  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 
1070 aa  595  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  33.76 
 
 
1095 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  35.8 
 
 
1028 aa  595  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 
1036 aa  586  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  36.05 
 
 
1047 aa  588  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 
1041 aa  586  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 
1059 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  34.05 
 
 
1044 aa  585  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 
1041 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  34.42 
 
 
1040 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  36 
 
 
1028 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 
1028 aa  582  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  34.52 
 
 
1075 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 
1066 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 
1039 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 
1046 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 
1065 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  36.29 
 
 
1028 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 
1051 aa  566  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  34.63 
 
 
1050 aa  568  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  34.18 
 
 
1041 aa  562  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  32.2 
 
 
1048 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  31.42 
 
 
1050 aa  556  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 
1177 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 
1049 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 
1038 aa  555  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  35.64 
 
 
1033 aa  556  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 
1006 aa  549  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 
1054 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  34.85 
 
 
1054 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 
1054 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.53 
 
 
1024 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  32.73 
 
 
1062 aa  537  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 
1171 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  34.32 
 
 
1101 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  30.57 
 
 
1040 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 
1014 aa  530  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 
1026 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 
1031 aa  528  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  34.77 
 
 
1035 aa  528  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 
1055 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  34.74 
 
 
1045 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  36.23 
 
 
1057 aa  521  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 
1067 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3831  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 
1024 aa  511  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2346  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 
1024 aa  512  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  hitchhiker  0.00300678 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 
1033 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>