More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0882 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  38.08 
 
 
1087 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  37.4 
 
 
1069 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1057 aa  2068    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2586  acriflavin resistance protein  36.83 
 
 
1061 aa  622  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3520  acriflavin resistance protein  36.83 
 
 
1061 aa  622  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 
1070 aa  619  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  36.37 
 
 
1079 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  37.24 
 
 
1084 aa  560  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 
1011 aa  558  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.44 
 
 
1050 aa  535  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  36.23 
 
 
1043 aa  535  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.06 
 
 
1044 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 
1034 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 
1044 aa  516  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3831  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 
1024 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 
1034 aa  516  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2346  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 
1024 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  hitchhiker  0.00300678 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 
1040 aa  507  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 
1023 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 
1026 aa  502  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 
1043 aa  502  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  35.36 
 
 
1027 aa  496  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 
1053 aa  492  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.34 
 
 
1024 aa  476  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 
1082 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.61 
 
 
1046 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 
1173 aa  465  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 
1028 aa  466  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 
1017 aa  464  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 
1024 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 
1087 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.86 
 
 
1049 aa  458  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 
1086 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 
1102 aa  459  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.31 
 
 
1081 aa  458  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  31.46 
 
 
1496 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.71 
 
 
1122 aa  455  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 
1083 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 
1058 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 
1055 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 
1036 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 
1065 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 
1051 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 
1058 aa  440  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 
1039 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 
1048 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 
1041 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 
1028 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 
1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 
1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 
1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 
1032 aa  436  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 
1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 
1087 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  30.59 
 
 
1069 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 
1028 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 
1034 aa  432  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 
1038 aa  430  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 
1083 aa  432  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 
1087 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 
1087 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  29.05 
 
 
1058 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.26 
 
 
1091 aa  429  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 
1059 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 
1039 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 
1101 aa  428  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 
1470 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30.57 
 
 
1036 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 
1027 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 
1071 aa  422  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  29.35 
 
 
1070 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 
1028 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 
1041 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 
1095 aa  422  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 
1044 aa  423  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 
1030 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 
1040 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 
1042 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 
1041 aa  419  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 
1047 aa  419  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 
1054 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 
1049 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 
1054 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.58 
 
 
1063 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.62 
 
 
1024 aa  412  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 
1058 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 
1054 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 
1031 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 
1060 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 
1050 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1019  acriflavin resistance protein  29.36 
 
 
1058 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 
1033 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 
1050 aa  406  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 
1038 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 
1029 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 
1048 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 
1041 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 
1006 aa  400  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 
1075 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 
1055 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>