More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3179 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  39.47 
 
 		 1011 aa  685    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.1 
 
 		 1050 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1023 aa  2048    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  37.68 
 
 		 1034 aa  655    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  35.91 
 
 		 1044 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  35.84 
 
 		 1044 aa  602  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  35.02 
 
 		 1043 aa  598  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  35.44 
 
 		 1040 aa  579  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  34.76 
 
 		 1034 aa  575  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.69 
 
 		 1043 aa  560  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 		 1086 aa  539  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1017 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  34.07 
 
 		 1027 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  33.39 
 
 		 1087 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 		 1044 aa  513  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.3 
 
 		 1091 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.15 
 
 		 1050 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1055 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 		 1041 aa  512  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1034 aa  511  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 		 1041 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 		 1046 aa  509  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  34.07 
 
 		 1028 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  31.04 
 
 		 1036 aa  504  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.21 
 
 		 1024 aa  504  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1038 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  31.96 
 
 		 1039 aa  506  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1058 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1173 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1041 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.79 
 
 		 1122 aa  498  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1058 aa  497  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.18 
 
 		 1049 aa  494  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1063 aa  495  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1039 aa  496  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1053 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1046 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1024 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1026 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.98 
 
 		 1496 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1032 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1028 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1058 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1059 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1038 aa  480  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1028 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1041 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1027 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.19 
 
 		 1024 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 		 1074 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.91 
 
 		 1069 aa  475  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1070 aa  468  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1470 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1104 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1015 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1065 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1036 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 		 1065 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1040 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.01 
 
 		 1048 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1028 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1033 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  29.35 
 
 		 1030 aa  459  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1071 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1016 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 		 1075 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1026 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1050 aa  457  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1049 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1057 aa  458  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1055 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.39 
 
 		 1014 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  30.27 
 
 		 1035 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  32.27 
 
 		 1064 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 		 1028 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1051 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 		 1006 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.36 
 
 		 1038 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1048 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1031 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.27 
 
 		 1038 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1038 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1038 aa  452  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 		 1087 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.27 
 
 		 1038 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1075 aa  452  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1054 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1054 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 		 1030 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 		 1014 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.43 
 
 		 1039 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1014 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0559  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1000 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0052837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.17 
 
 		 1038 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.27 
 
 		 1014 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1054 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 		 1031 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.89 
 
 		 1038 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  28.59 
 
 		 1035 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 		 1064 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>