More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2131 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  38.35 
 
 		 1050 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2782  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.34 
 
 		 1036 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0804863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  40.18 
 
 		 1014 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  40.43 
 
 		 1027 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1024 aa  2047    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  47.39 
 
 		 1031 aa  905    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  47.39 
 
 		 1031 aa  904    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  40.72 
 
 		 1036 aa  708    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  38.79 
 
 		 1049 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45 
 
 		 1029 aa  800    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.03 
 
 		 1043 aa  646    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  40.1 
 
 		 1025 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  40.19 
 
 		 1029 aa  730    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.7 
 
 		 1031 aa  899    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.46 
 
 		 1046 aa  725    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  46.5 
 
 		 1046 aa  847    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1045  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  39.29 
 
 		 1033 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  40.16 
 
 		 1015 aa  741    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  39.94 
 
 		 1032 aa  722    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  40.31 
 
 		 1015 aa  741    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  52.19 
 
 		 1040 aa  976    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0528  acriflavin resistance protein  39.61 
 
 		 1026 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  46.8 
 
 		 1031 aa  888    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  51.69 
 
 		 1064 aa  1028    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2737  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  36.97 
 
 		 1026 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.917561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2283  acriflavin resistance protein  39.86 
 
 		 1031 aa  696    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.16 
 
 		 1057 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0079  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  39.29 
 
 		 1036 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0201  acriflavin resistance protein  39.31 
 
 		 1028 aa  697    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  39.36 
 
 		 1025 aa  708    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  40.77 
 
 		 1009 aa  738    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  39.25 
 
 		 1048 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2803  RND family multidrug/cation transporter  39.9 
 
 		 1025 aa  701    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2244  AcrB/AcrD/AcrF cation/multidrug efflux pump  39.69 
 
 		 1030 aa  692    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1497  RND HAE1/HME family protein  39.29 
 
 		 1036 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  40.43 
 
 		 1029 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  47.89 
 
 		 1048 aa  932    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  42.91 
 
 		 1028 aa  788    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  38.56 
 
 		 1026 aa  688    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  41.42 
 
 		 1032 aa  772    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  40.87 
 
 		 1046 aa  714    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  45.61 
 
 		 1042 aa  885    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  46.67 
 
 		 1037 aa  864    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  40.6 
 
 		 1029 aa  750    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  40.77 
 
 		 1047 aa  710    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1287  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  39.39 
 
 		 1036 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  39.35 
 
 		 1048 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  39.37 
 
 		 1029 aa  687    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2236  acriflavin resistance protein  38.24 
 
 		 1047 aa  666    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0032  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  39.29 
 
 		 1033 aa  671    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3649  acriflavin resistance protein  39.9 
 
 		 1035 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1118  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.11 
 
 		 1043 aa  643    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0778165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1651  acriflavin resistance protein  38.95 
 
 		 1026 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  49.36 
 
 		 1038 aa  869    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1024  acriflavin resistance protein  39.08 
 
 		 1037 aa  674    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197282 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1988  acriflavin resistance protein  37.43 
 
 		 1011 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  40.37 
 
 		 1014 aa  723    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  56.07 
 
 		 1022 aa  1115    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  52.22 
 
 		 1051 aa  1032    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  39.45 
 
 		 1031 aa  654    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  37.93 
 
 		 1043 aa  642    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  44.9 
 
 		 1031 aa  848    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  39.61 
 
 		 1034 aa  703    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  42.69 
 
 		 1042 aa  742    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3139  acriflavin resistance protein  37.96 
 
 		 1012 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389349  normal  0.483157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  46.61 
 
 		 1035 aa  837    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2699  acriflavin resistance protein  39.57 
 
 		 1029 aa  706    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0382  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  39.29 
 
 		 1033 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  39.63 
 
 		 1028 aa  716    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  40.77 
 
 		 1047 aa  709    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  46 
 
 		 1036 aa  828    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  40.08 
 
 		 1024 aa  716    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  38.15 
 
 		 1040 aa  653    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  38.08 
 
 		 1036 aa  697    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  43.76 
 
 		 1026 aa  818    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  41.59 
 
 		 1030 aa  781    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 		 1044 aa  663    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.03 
 
 		 1068 aa  854    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  41.86 
 
 		 1051 aa  732    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  46.8 
 
 		 1031 aa  906    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  41.95 
 
 		 1051 aa  730    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  46.9 
 
 		 1031 aa  907    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  49.61 
 
 		 1036 aa  925    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1155  acriflavin resistance protein  39.76 
 
 		 1025 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  40.28 
 
 		 1034 aa  730    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  44.29 
 
 		 1040 aa  798    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09520  RND efflux transporter  39.56 
 
 		 1029 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  41.75 
 
 		 1018 aa  775    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  41.65 
 
 		 1018 aa  772    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1581  RND HAE1/HME family protein  39.29 
 
 		 1036 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3678  acriflavin resistance protein  40.24 
 
 		 1027 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  40.1 
 
 		 1017 aa  737    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1202  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  39.29 
 
 		 1033 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0371  acriflavin resistance protein  37.78 
 
 		 1029 aa  676    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  41.95 
 
 		 1051 aa  733    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  46.8 
 
 		 1031 aa  906    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0768  acriflavin resistance protein  40.46 
 
 		 1032 aa  688    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  39.17 
 
 		 1033 aa  693    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.74 
 
 		 1034 aa  885    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3269  putative multidrug resistance protein  37.9 
 
 		 1023 aa  682    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>