More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0291 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  38.53 
 
 
1038 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  36.41 
 
 
1022 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.82 
 
 
1024 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  61.56 
 
 
1049 aa  1227    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  62.49 
 
 
1051 aa  1281    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.39 
 
 
1029 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  99.81 
 
 
1043 aa  2061    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.51 
 
 
1031 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  37.68 
 
 
1064 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  93.66 
 
 
1050 aa  1824    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  36.24 
 
 
1037 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  62.78 
 
 
1044 aa  1295    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  38.88 
 
 
1031 aa  702    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  63.05 
 
 
1044 aa  1307    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  39.32 
 
 
1031 aa  715    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  39.13 
 
 
1030 aa  728    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  38.9 
 
 
1031 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  62.13 
 
 
1048 aa  1204    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  39.52 
 
 
1034 aa  716    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  37.65 
 
 
1035 aa  672    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01699  RND family efflux transporter  45.23 
 
 
1038 aa  858    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  37.91 
 
 
1028 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  42.79 
 
 
1037 aa  778    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  38.3 
 
 
1031 aa  695    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 
1046 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  39.01 
 
 
1024 aa  655    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  38.62 
 
 
1023 aa  663    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  36.42 
 
 
1036 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  38.76 
 
 
1041 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  62.33 
 
 
1048 aa  1206    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  40.98 
 
 
1052 aa  669    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  37.1 
 
 
1051 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  62.2 
 
 
1051 aa  1296    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  38.88 
 
 
1031 aa  679    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  37.34 
 
 
1029 aa  659    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  41.07 
 
 
1038 aa  698    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  41.92 
 
 
1048 aa  788    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  37.54 
 
 
1036 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  66.57 
 
 
1040 aa  1379    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.59 
 
 
1034 aa  692    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  38.42 
 
 
1031 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  38.42 
 
 
1031 aa  706    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  42.55 
 
 
1036 aa  755    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  40.19 
 
 
1040 aa  693    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  38.8 
 
 
1031 aa  701    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  100 
 
 
1043 aa  2069    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  40.5 
 
 
1042 aa  728    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  38.88 
 
 
1031 aa  700    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  38.42 
 
 
1031 aa  706    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  35.75 
 
 
1037 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  35.79 
 
 
1034 aa  635  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  38.03 
 
 
1048 aa  632  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  39.37 
 
 
1025 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 
1036 aa  622  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  38.04 
 
 
1035 aa  622  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 
1037 aa  618  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  35.83 
 
 
1033 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  36.51 
 
 
1042 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  35.17 
 
 
1035 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 
1035 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  35.99 
 
 
1051 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  36.09 
 
 
1051 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  36.09 
 
 
1051 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  37.37 
 
 
1045 aa  602  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  35.51 
 
 
1046 aa  599  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  37.4 
 
 
1041 aa  597  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.57 
 
 
1046 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  34.39 
 
 
1037 aa  594  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  35.89 
 
 
1047 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  33.33 
 
 
1068 aa  593  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  35.7 
 
 
1047 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  35.8 
 
 
1047 aa  592  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  34.62 
 
 
1032 aa  592  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  35.7 
 
 
1047 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  34.27 
 
 
1030 aa  591  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  38.32 
 
 
1040 aa  583  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 
1037 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  33.14 
 
 
1026 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 
1036 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 
1029 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 
1028 aa  539  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  34.58 
 
 
1018 aa  526  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  34.68 
 
 
1018 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  32.23 
 
 
1019 aa  522  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  33.69 
 
 
1014 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  32.13 
 
 
1019 aa  522  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 
1040 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  31.96 
 
 
1012 aa  521  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  31.96 
 
 
1012 aa  521  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  33.7 
 
 
1014 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0201  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 
1028 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  33.1 
 
 
1009 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0857  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 
1033 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533856  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  33.63 
 
 
1017 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  33.66 
 
 
1014 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  33.76 
 
 
1024 aa  516  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  32.95 
 
 
1015 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  33.14 
 
 
1015 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  30.54 
 
 
1040 aa  511  1e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  32.79 
 
 
1034 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>