More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0704 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  47.32 
 
 		 1046 aa  917    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  38.54 
 
 		 1018 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  53.38 
 
 		 1041 aa  1040    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  59.98 
 
 		 1030 aa  1275    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  37.66 
 
 		 1014 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  47.42 
 
 		 1047 aa  915    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  35.82 
 
 		 1034 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.38 
 
 		 1024 aa  901    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  43.14 
 
 		 1064 aa  790    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  37.39 
 
 		 1017 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  47.86 
 
 		 1037 aa  940    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  56.44 
 
 		 1029 aa  1135    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.76 
 
 		 1043 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  59.69 
 
 		 1034 aa  1262    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  59.44 
 
 		 1031 aa  1256    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  58.66 
 
 		 1031 aa  1251    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.74 
 
 		 1046 aa  910    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  36.51 
 
 		 1019 aa  642    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  38.66 
 
 		 1043 aa  664    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  38.63 
 
 		 1028 aa  646    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  46.96 
 
 		 1033 aa  917    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  43.33 
 
 		 1040 aa  728    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  38.67 
 
 		 1036 aa  692    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  60.45 
 
 		 1034 aa  1275    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  37.24 
 
 		 1028 aa  637    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  60.29 
 
 		 1035 aa  1235    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  47.42 
 
 		 1047 aa  914    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  42.93 
 
 		 1048 aa  737    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  37.87 
 
 		 1037 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.65 
 
 		 1057 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  47.09 
 
 		 1036 aa  919    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  45.22 
 
 		 1024 aa  838    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  39.46 
 
 		 1051 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1038 aa  2062    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  47.25 
 
 		 1023 aa  848    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  38 
 
 		 1009 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  39.42 
 
 		 1048 aa  671    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  48.79 
 
 		 1045 aa  883    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  38.22 
 
 		 1014 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  61.09 
 
 		 1046 aa  1253    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  36.84 
 
 		 1022 aa  648    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  38.99 
 
 		 1049 aa  670    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  47.47 
 
 		 1036 aa  924    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  54.05 
 
 		 1041 aa  1030    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  50.44 
 
 		 1028 aa  1011    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  45.44 
 
 		 1022 aa  857    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  37.88 
 
 		 1014 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  40.02 
 
 		 1044 aa  718    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  35.22 
 
 		 1012 aa  637    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  47.86 
 
 		 1037 aa  929    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  38.44 
 
 		 1029 aa  660    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  59.34 
 
 		 1031 aa  1254    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  54.41 
 
 		 1038 aa  1009    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  48.04 
 
 		 1035 aa  935    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  39.38 
 
 		 1037 aa  747    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  59.24 
 
 		 1031 aa  1251    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  38.96 
 
 		 1037 aa  719    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  48.49 
 
 		 1042 aa  920    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  59.34 
 
 		 1031 aa  1243    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  45.79 
 
 		 1025 aa  786    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  39.36 
 
 		 1048 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  39.69 
 
 		 1029 aa  675    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  61.09 
 
 		 1042 aa  1267    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  47.42 
 
 		 1047 aa  915    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  42.71 
 
 		 1051 aa  795    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  59.34 
 
 		 1031 aa  1227    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  36.18 
 
 		 1034 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  36.51 
 
 		 1019 aa  642    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  59.34 
 
 		 1031 aa  1253    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  47.84 
 
 		 1035 aa  932    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  58.74 
 
 		 1035 aa  1165    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 		 1040 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  51.69 
 
 		 1048 aa  1033    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  47.42 
 
 		 1047 aa  914    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  61.14 
 
 		 1031 aa  1276    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1198  RND efflux transporter  36.62 
 
 		 1022 aa  639    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  59.9 
 
 		 1036 aa  1207    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  62.06 
 
 		 1052 aa  1183    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  41.17 
 
 		 1040 aa  722    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  36.28 
 
 		 1026 aa  680    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  37.46 
 
 		 1030 aa  700    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  38.36 
 
 		 1032 aa  720    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.12 
 
 		 1068 aa  804    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  47.52 
 
 		 1051 aa  917    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  58.95 
 
 		 1031 aa  1263    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  38.2 
 
 		 1044 aa  679    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  47.32 
 
 		 1051 aa  915    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  59.05 
 
 		 1031 aa  1262    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  42.62 
 
 		 1029 aa  788    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  53.17 
 
 		 1036 aa  1028    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  46.86 
 
 		 1034 aa  934    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  52.63 
 
 		 1040 aa  998    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  38.93 
 
 		 1051 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  38.66 
 
 		 1050 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  37.76 
 
 		 1014 aa  648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  38.54 
 
 		 1018 aa  663    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  47.57 
 
 		 1037 aa  928    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3904  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  37.29 
 
 		 1041 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.31694  normal  0.33594 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  47.52 
 
 		 1051 aa  917    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  58.95 
 
 		 1031 aa  1263    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>