More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4296 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  50.74 
 
 		 1036 aa  1040    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  54.04 
 
 		 1014 aa  1080    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  55.34 
 
 		 1018 aa  1075    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  56.15 
 
 		 1029 aa  1192    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.71 
 
 		 1034 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2782  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.98 
 
 		 1036 aa  934    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0804863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  54.3 
 
 		 1014 aa  1083    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  53.6 
 
 		 1027 aa  1108    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  39.76 
 
 		 1040 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.93 
 
 		 1024 aa  719    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3678  acriflavin resistance protein  53.79 
 
 		 1027 aa  1100    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.51 
 
 		 1030 aa  710    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  51.14 
 
 		 1040 aa  1041    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  54.55 
 
 		 1014 aa  1074    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  36.19 
 
 		 1031 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0929  acriflavin resistance protein  51.63 
 
 		 1033 aa  1040    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1155  acriflavin resistance protein  49.17 
 
 		 1025 aa  951    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  51.34 
 
 		 1029 aa  994    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.92 
 
 		 1031 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  41.94 
 
 		 1024 aa  761    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  47.6 
 
 		 1026 aa  975    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0111  acriflavin resistance protein  42.62 
 
 		 1028 aa  815    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1497  RND HAE1/HME family protein  57.82 
 
 		 1036 aa  1182    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1045  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  57.52 
 
 		 1033 aa  1149    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  57.78 
 
 		 1015 aa  1152    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1034 aa  2088    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  57.88 
 
 		 1015 aa  1156    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2283  acriflavin resistance protein  84.14 
 
 		 1031 aa  1729    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7711  acriflavin resistance protein  50.1 
 
 		 1017 aa  972    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  53.55 
 
 		 1017 aa  1065    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0079  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  57.82 
 
 		 1036 aa  1182    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0201  acriflavin resistance protein  50 
 
 		 1028 aa  991    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  56.3 
 
 		 1025 aa  1161    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  53.93 
 
 		 1009 aa  1088    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2803  RND family multidrug/cation transporter  49.56 
 
 		 1025 aa  958    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2244  AcrB/AcrD/AcrF cation/multidrug efflux pump  47.42 
 
 		 1030 aa  927    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  37.17 
 
 		 1031 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  49.56 
 
 		 1025 aa  959    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  35.94 
 
 		 1042 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  37.17 
 
 		 1031 aa  662    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0528  acriflavin resistance protein  51.78 
 
 		 1026 aa  1033    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  37.17 
 
 		 1031 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  52.34 
 
 		 1029 aa  1009    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  54.14 
 
 		 1019 aa  1105    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3802  acriflavin resistance protein  48.16 
 
 		 1058 aa  917    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578442  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  54.43 
 
 		 1029 aa  1091    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1287  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  57.72 
 
 		 1036 aa  1194    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2737  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  50.15 
 
 		 1026 aa  972    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.917561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2236  acriflavin resistance protein  45.87 
 
 		 1047 aa  895    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1024  acriflavin resistance protein  46.18 
 
 		 1037 aa  902    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3649  acriflavin resistance protein  92.05 
 
 		 1035 aa  1892    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1118  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.16 
 
 		 1043 aa  912    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0778165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1651  acriflavin resistance protein  87.17 
 
 		 1026 aa  1806    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3372  acriflavin resistance protein  48.63 
 
 		 1021 aa  922    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1202  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  57.52 
 
 		 1033 aa  1149    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0382  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  57.52 
 
 		 1033 aa  1149    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  83.01 
 
 		 1032 aa  1757    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  39.55 
 
 		 1051 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  40.83 
 
 		 1022 aa  776    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1587  acriflavin resistance protein  40.95 
 
 		 1019 aa  746    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268577  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0945  acriflavin resistance protein  51.14 
 
 		 1021 aa  1057    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0774817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  90.33 
 
 		 1034 aa  1923    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3139  acriflavin resistance protein  53.91 
 
 		 1012 aa  1111    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389349  normal  0.483157 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1988  acriflavin resistance protein  48.27 
 
 		 1011 aa  942    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  36.29 
 
 		 1012 aa  636    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  49.61 
 
 		 1028 aa  1009    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2699  acriflavin resistance protein  84.04 
 
 		 1029 aa  1742    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4150  acriflavin resistance protein  50.25 
 
 		 1027 aa  1018    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  54.06 
 
 		 1026 aa  1111    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  54.34 
 
 		 1019 aa  1106    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1581  RND HAE1/HME family protein  57.82 
 
 		 1036 aa  1182    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2411  acriflavin resistance protein  50.25 
 
 		 1013 aa  971    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.848579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  50.05 
 
 		 1024 aa  973    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  37.56 
 
 		 1031 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0357  acriflavin resistance protein  50.25 
 
 		 1030 aa  1016    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0465  acriflavin resistance protein  49.61 
 
 		 1025 aa  1007    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.471269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0615  cation/multidrug efflux protein  46.65 
 
 		 1038 aa  874    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0089  putative integral membrane component of multidrug efflux system  50.78 
 
 		 1022 aa  1036    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  37.07 
 
 		 1031 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 		 1031 aa  670    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0090  acriflavin resistance protein  48.98 
 
 		 1020 aa  902    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  41.19 
 
 		 1025 aa  703    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 		 1031 aa  670    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1638  acriflavin resistance protein  46.21 
 
 		 1047 aa  898    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355465  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5960  acriflavin resistance protein  49.8 
 
 		 1017 aa  973    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.618564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  36.3 
 
 		 1048 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  36.48 
 
 		 1030 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  54.6 
 
 		 1014 aa  1079    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  41.12 
 
 		 1023 aa  732    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1553  acriflavin resistance protein  50.63 
 
 		 1026 aa  947    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000421809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09520  RND efflux transporter  56.25 
 
 		 1029 aa  1190    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  55.44 
 
 		 1018 aa  1078    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3269  putative multidrug resistance protein  49.46 
 
 		 1023 aa  991    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  36.58 
 
 		 1034 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0371  acriflavin resistance protein  50.84 
 
 		 1029 aa  1009    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1055  acriflavin resistance protein  51.81 
 
 		 686 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.393626 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 		 1031 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0032  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  57.52 
 
 		 1033 aa  1149    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0768  acriflavin resistance protein  47.85 
 
 		 1032 aa  926    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  38.96 
 
 		 1064 aa  713    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>