More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2223 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 		 1031 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  37.6 
 
 		 1029 aa  637    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  37.64 
 
 		 1031 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.25 
 
 		 1024 aa  687    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  62.22 
 
 		 1043 aa  1214    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.58 
 
 		 1031 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  62.1 
 
 		 1050 aa  1201    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  39.86 
 
 		 1024 aa  661    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  53.27 
 
 		 1044 aa  1083    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  59.9 
 
 		 1051 aa  1194    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  40.65 
 
 		 1023 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 		 1031 aa  665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  61.08 
 
 		 1044 aa  1230    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  100 
 
 		 1048 aa  2056    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  38.21 
 
 		 1035 aa  677    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  39.38 
 
 		 1028 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  39.05 
 
 		 1042 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  42.73 
 
 		 1037 aa  773    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  59.41 
 
 		 1051 aa  1184    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  38.76 
 
 		 1031 aa  665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  38.25 
 
 		 1022 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01699  RND family efflux transporter  44.83 
 
 		 1038 aa  813    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  92.76 
 
 		 1049 aa  1889    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  38.23 
 
 		 1046 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  38.16 
 
 		 1030 aa  680    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  42.25 
 
 		 1048 aa  780    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  38.79 
 
 		 1031 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  39.48 
 
 		 1031 aa  661    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  39.42 
 
 		 1038 aa  662    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  99.52 
 
 		 1048 aa  2047    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  38.44 
 
 		 1031 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  38.43 
 
 		 1064 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  38.22 
 
 		 1034 aa  675    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  43.87 
 
 		 1038 aa  722    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  38.57 
 
 		 1036 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  62.61 
 
 		 1040 aa  1275    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  39.04 
 
 		 1031 aa  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  38.96 
 
 		 1031 aa  678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  44.3 
 
 		 1036 aa  766    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  39.11 
 
 		 1040 aa  657    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  62.12 
 
 		 1043 aa  1210    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  39.04 
 
 		 1031 aa  678    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.72 
 
 		 1034 aa  663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  40.35 
 
 		 1052 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.91 
 
 		 1029 aa  632  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  37.02 
 
 		 1051 aa  629  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  34.75 
 
 		 1068 aa  629  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  39.26 
 
 		 1025 aa  625  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  35.15 
 
 		 1037 aa  617  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  37.26 
 
 		 1041 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  39.21 
 
 		 1035 aa  613  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  35.86 
 
 		 1034 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  35.04 
 
 		 1032 aa  611  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  35.21 
 
 		 1037 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  38.96 
 
 		 1045 aa  608  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  36.66 
 
 		 1041 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  38.63 
 
 		 1048 aa  605  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  35.47 
 
 		 1035 aa  601  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  34.3 
 
 		 1030 aa  600  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1037 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  35.01 
 
 		 1036 aa  598  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  35.83 
 
 		 1035 aa  597  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  36.33 
 
 		 1042 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  35.67 
 
 		 1033 aa  595  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  34.37 
 
 		 1036 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.21 
 
 		 1046 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1051 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  34.86 
 
 		 1046 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 		 1051 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 		 1051 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1047 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1047 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1047 aa  582  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  35.06 
 
 		 1047 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  38.78 
 
 		 1040 aa  582  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 		 1037 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  35.72 
 
 		 1036 aa  576  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1037 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  33.96 
 
 		 1026 aa  568  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  36.91 
 
 		 1024 aa  559  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  34.17 
 
 		 1029 aa  551  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  35.36 
 
 		 1028 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  36.08 
 
 		 1018 aa  552  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  36.22 
 
 		 1025 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  35.72 
 
 		 1018 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  34.34 
 
 		 1040 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2803  RND family multidrug/cation transporter  36.03 
 
 		 1025 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  35.53 
 
 		 1014 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0857  acriflavin resistance protein  35.63 
 
 		 1033 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  35.53 
 
 		 1014 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  35.28 
 
 		 1014 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  35.66 
 
 		 1029 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1155  acriflavin resistance protein  35.98 
 
 		 1025 aa  539  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  35.31 
 
 		 1014 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 		 1031 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  34.02 
 
 		 1017 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  34.53 
 
 		 1037 aa  531  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  35.31 
 
 		 1029 aa  528  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  32.28 
 
 		 1019 aa  528  1e-148  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  34.27 
 
 		 1032 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>