More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1155 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  48.97 
 
 		 1017 aa  958    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1988  acriflavin resistance protein  42.27 
 
 		 1011 aa  781    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2782  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.34 
 
 		 1036 aa  787    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0804863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  48.29 
 
 		 1014 aa  939    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0032  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  46.72 
 
 		 1033 aa  847    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  45.71 
 
 		 1027 aa  885    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.76 
 
 		 1024 aa  707    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001981  RND multidrug efflux transporter  44.15 
 
 		 1040 aa  857    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  48.68 
 
 		 1040 aa  979    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2737  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  42.93 
 
 		 1026 aa  803    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.917561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  47.09 
 
 		 1028 aa  874    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  44.87 
 
 		 1026 aa  878    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  69.57 
 
 		 1029 aa  1411    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  69.21 
 
 		 1029 aa  1387    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2951  acriflavin resistance protein  43.17 
 
 		 1038 aa  818    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4150  acriflavin resistance protein  42.98 
 
 		 1027 aa  830    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0090  acriflavin resistance protein  42.42 
 
 		 1020 aa  721    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3269  putative multidrug resistance protein  43.59 
 
 		 1023 aa  830    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  42.33 
 
 		 1028 aa  818    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1045  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  46.72 
 
 		 1033 aa  847    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  46.75 
 
 		 1015 aa  913    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0857  acriflavin resistance protein  45.38 
 
 		 1033 aa  840    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533856  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  46.85 
 
 		 1015 aa  912    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1878  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  44.82 
 
 		 1026 aa  807    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1581  RND HAE1/HME family protein  46.91 
 
 		 1036 aa  878    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7711  acriflavin resistance protein  43.04 
 
 		 1017 aa  804    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8251  acriflavin resistance protein  44.73 
 
 		 1021 aa  833    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2283  acriflavin resistance protein  49.75 
 
 		 1031 aa  948    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2411  acriflavin resistance protein  42.6 
 
 		 1013 aa  804    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.848579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0079  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  46.91 
 
 		 1036 aa  878    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0201  acriflavin resistance protein  46.49 
 
 		 1028 aa  878    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1638  acriflavin resistance protein  41.75 
 
 		 1047 aa  768    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  44.02 
 
 		 1025 aa  865    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1202  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  46.72 
 
 		 1033 aa  847    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0357  acriflavin resistance protein  43.72 
 
 		 1030 aa  830    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  48.96 
 
 		 1009 aa  955    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1497  RND HAE1/HME family protein  46.91 
 
 		 1036 aa  878    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2803  RND family multidrug/cation transporter  95.32 
 
 		 1025 aa  1926    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2244  AcrB/AcrD/AcrF cation/multidrug efflux pump  42.75 
 
 		 1030 aa  797    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  95.61 
 
 		 1025 aa  1930    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  38.39 
 
 		 1064 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3802  acriflavin resistance protein  41.56 
 
 		 1058 aa  749    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578442  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  48.38 
 
 		 1014 aa  941    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  46.05 
 
 		 1026 aa  889    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  46.1 
 
 		 1029 aa  882    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  42.27 
 
 		 1023 aa  722    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  43.95 
 
 		 1036 aa  870    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  39.92 
 
 		 1025 aa  682    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  48.91 
 
 		 1029 aa  939    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1287  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  46.82 
 
 		 1036 aa  892    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2236  acriflavin resistance protein  42.04 
 
 		 1047 aa  772    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3649  acriflavin resistance protein  49.12 
 
 		 1035 aa  945    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1118  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.14 
 
 		 1043 aa  795    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0778165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1651  acriflavin resistance protein  49.61 
 
 		 1026 aa  982    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3372  acriflavin resistance protein  42.28 
 
 		 1021 aa  772    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  48.96 
 
 		 1014 aa  934    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  49.65 
 
 		 1018 aa  965    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  42.44 
 
 		 1024 aa  730    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  38.13 
 
 		 1051 aa  684    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0768  acriflavin resistance protein  42.54 
 
 		 1032 aa  771    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1587  acriflavin resistance protein  35.99 
 
 		 1019 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0089  putative integral membrane component of multidrug efflux system  44.87 
 
 		 1022 aa  866    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  49.56 
 
 		 1034 aa  997    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1553  acriflavin resistance protein  44.82 
 
 		 1026 aa  807    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000421809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3139  acriflavin resistance protein  45.58 
 
 		 1012 aa  851    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389349  normal  0.483157 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1155  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1025 aa  2048    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  37.39 
 
 		 1030 aa  648    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2699  acriflavin resistance protein  50.05 
 
 		 1029 aa  969    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  48.88 
 
 		 1032 aa  988    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  48.96 
 
 		 1014 aa  936    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1024  acriflavin resistance protein  40.76 
 
 		 1037 aa  759    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0465  acriflavin resistance protein  43.92 
 
 		 1025 aa  840    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.471269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  71.92 
 
 		 1024 aa  1464    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0382  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  46.72 
 
 		 1033 aa  847    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5960  acriflavin resistance protein  43.76 
 
 		 1017 aa  827    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.618564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  49.17 
 
 		 1034 aa  965    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0615  cation/multidrug efflux protein  42.86 
 
 		 1038 aa  761    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1711  acriflavin resistance protein  41.65 
 
 		 1047 aa  765    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  45.78 
 
 		 1019 aa  902    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  43.38 
 
 		 1040 aa  848    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  45.98 
 
 		 1019 aa  902    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0111  acriflavin resistance protein  36.91 
 
 		 1028 aa  682    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0929  acriflavin resistance protein  47.33 
 
 		 1033 aa  901    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0945  acriflavin resistance protein  43.46 
 
 		 1021 aa  828    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0774817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0528  acriflavin resistance protein  43.92 
 
 		 1026 aa  839    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09520  RND efflux transporter  46.4 
 
 		 1029 aa  884    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3678  acriflavin resistance protein  45.42 
 
 		 1027 aa  867    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  49.55 
 
 		 1018 aa  965    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  37.94 
 
 		 1034 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0371  acriflavin resistance protein  43.2 
 
 		 1029 aa  808    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  38.3 
 
 		 1031 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  40.72 
 
 		 1022 aa  743    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  37.49 
 
 		 1042 aa  635  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  37.45 
 
 		 1031 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  36.83 
 
 		 1031 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  37.35 
 
 		 1031 aa  631  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  37.15 
 
 		 1031 aa  631  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  36.83 
 
 		 1031 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  37.35 
 
 		 1031 aa  631  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  36.73 
 
 		 1031 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>