More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1553 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3496  acriflavin resistance protein  50.05 
 
 		 1026 aa  1006    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  49.32 
 
 		 1017 aa  975    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  49.81 
 
 		 1032 aa  1024    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  50.63 
 
 		 1034 aa  1013    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0528  acriflavin resistance protein  54.99 
 
 		 1026 aa  1074    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2782  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.12 
 
 		 1036 aa  874    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0804863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  48.87 
 
 		 1014 aa  958    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  40.04 
 
 		 1023 aa  687    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  44.85 
 
 		 1027 aa  856    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.63 
 
 		 1024 aa  695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0288  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.75 
 
 		 1030 aa  678    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1553  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1026 aa  2060    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000421809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0857  acriflavin resistance protein  48.78 
 
 		 1033 aa  953    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0357  acriflavin resistance protein  46.2 
 
 		 1030 aa  892    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  36.24 
 
 		 1048 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  46.01 
 
 		 1029 aa  880    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1878  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  100 
 
 		 1026 aa  2060    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0974  multidrug efflux protein  49.26 
 
 		 1014 aa  959    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543426  normal  0.0386559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  37.25 
 
 		 1064 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  36.68 
 
 		 1035 aa  638    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0929  acriflavin resistance protein  49.46 
 
 		 1033 aa  981    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1045  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  46.94 
 
 		 1033 aa  869    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  50.49 
 
 		 1015 aa  985    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3678  acriflavin resistance protein  44.85 
 
 		 1027 aa  841    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  50.68 
 
 		 1015 aa  989    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3802  acriflavin resistance protein  43.75 
 
 		 1058 aa  829    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578442  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  48.67 
 
 		 1014 aa  953    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1496  acriflavin resistance protein  45.31 
 
 		 1025 aa  865    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2283  acriflavin resistance protein  49.9 
 
 		 1031 aa  948    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8251  acriflavin resistance protein  44.51 
 
 		 1021 aa  845    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236714  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0079  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  47.23 
 
 		 1036 aa  899    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0201  acriflavin resistance protein  52.05 
 
 		 1028 aa  1070    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  45.37 
 
 		 1025 aa  898    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  39.41 
 
 		 1022 aa  731    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  48.78 
 
 		 1009 aa  966    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2803  RND family multidrug/cation transporter  45.02 
 
 		 1025 aa  859    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2244  AcrB/AcrD/AcrF cation/multidrug efflux pump  46.31 
 
 		 1030 aa  892    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  45.62 
 
 		 1029 aa  880    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0465  acriflavin resistance protein  45.03 
 
 		 1025 aa  884    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.471269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1581  RND HAE1/HME family protein  47.23 
 
 		 1036 aa  899    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3476  acriflavin resistance protein  44.69 
 
 		 1028 aa  865    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5960  acriflavin resistance protein  49.8 
 
 		 1017 aa  952    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.618564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3699  acriflavin resistance protein  48.92 
 
 		 1029 aa  956    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.459748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1287  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  47.04 
 
 		 1036 aa  913    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0382  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  46.94 
 
 		 1033 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2236  acriflavin resistance protein  43.92 
 
 		 1047 aa  827    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1202  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  46.94 
 
 		 1033 aa  869    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3649  acriflavin resistance protein  50.63 
 
 		 1035 aa  988    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1118  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.88 
 
 		 1043 aa  830    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0778165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1651  acriflavin resistance protein  50.34 
 
 		 1026 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3372  acriflavin resistance protein  49.66 
 
 		 1021 aa  930    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2737  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  49.23 
 
 		 1026 aa  939    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.917561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  44.46 
 
 		 1040 aa  848    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  49.21 
 
 		 1018 aa  969    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  36.31 
 
 		 1051 aa  641    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1155  acriflavin resistance protein  44.82 
 
 		 1025 aa  852    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1988  acriflavin resistance protein  47.75 
 
 		 1011 aa  915    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1587  acriflavin resistance protein  39.18 
 
 		 1019 aa  673    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268577  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  38.45 
 
 		 1025 aa  642    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  50.05 
 
 		 1034 aa  1019    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3139  acriflavin resistance protein  43.89 
 
 		 1012 aa  838    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389349  normal  0.483157 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0032  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  46.94 
 
 		 1033 aa  869    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  44.55 
 
 		 1026 aa  856    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2699  acriflavin resistance protein  50.3 
 
 		 1029 aa  969    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7711  acriflavin resistance protein  49.32 
 
 		 1017 aa  958    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0089  putative integral membrane component of multidrug efflux system  44.4 
 
 		 1022 aa  849    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2411  acriflavin resistance protein  50.29 
 
 		 1013 aa  963    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.848579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  45.53 
 
 		 1024 aa  883    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  51.77 
 
 		 1019 aa  1047    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1497  RND HAE1/HME family protein  47.23 
 
 		 1036 aa  899    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  40.59 
 
 		 1024 aa  721    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0615  cation/multidrug efflux protein  40.93 
 
 		 1038 aa  724    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0945  acriflavin resistance protein  43.07 
 
 		 1021 aa  842    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0774817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1711  acriflavin resistance protein  43.73 
 
 		 1047 aa  827    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4150  acriflavin resistance protein  45.39 
 
 		 1027 aa  890    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4481  multidrug efflux protein  48.82 
 
 		 1014 aa  950    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750514  normal  0.872704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  51.13 
 
 		 1028 aa  994    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0111  acriflavin resistance protein  50.54 
 
 		 1028 aa  1017    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001981  RND multidrug efflux transporter  44.75 
 
 		 1040 aa  848    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1638  acriflavin resistance protein  44.02 
 
 		 1047 aa  832    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355465  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  45.34 
 
 		 1036 aa  873    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09520  RND efflux transporter  44.34 
 
 		 1029 aa  850    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  49.31 
 
 		 1018 aa  973    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0891  RND efflux transporter  44.23 
 
 		 1029 aa  850    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1024  acriflavin resistance protein  43.28 
 
 		 1037 aa  819    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0371  acriflavin resistance protein  46.06 
 
 		 1029 aa  881    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  51.77 
 
 		 1019 aa  1046    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2951  acriflavin resistance protein  45.01 
 
 		 1038 aa  877    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0090  acriflavin resistance protein  50.58 
 
 		 1020 aa  922    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3269  putative multidrug resistance protein  45.33 
 
 		 1023 aa  874    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0768  acriflavin resistance protein  47.34 
 
 		 1032 aa  892    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1055  acriflavin resistance protein  50 
 
 		 686 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.393626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  47.62 
 
 		 1040 aa  946    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.05 
 
 		 1068 aa  634  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  35.97 
 
 		 1029 aa  628  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  37.41 
 
 		 1022 aa  610  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  36.95 
 
 		 1040 aa  601  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1198  RND efflux transporter  37.11 
 
 		 1022 aa  601  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  35.21 
 
 		 1012 aa  597  1e-169  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  35.21 
 
 		 1012 aa  596  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>