More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01735 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0899  acriflavin resistance protein  38.21 
 
 		 1048 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  56.61 
 
 		 1031 aa  1171    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  38.42 
 
 		 1037 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  40.74 
 
 		 1040 aa  704    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0342  acriflavin resistance protein  37.65 
 
 		 1050 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  46.86 
 
 		 1036 aa  920    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  47.54 
 
 		 1037 aa  934    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2065  acriflavin resistance protein  37.51 
 
 		 1027 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.824615  normal  0.45428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.52 
 
 		 1024 aa  850    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0291  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  37.71 
 
 		 1043 aa  646    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1047 aa  882    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  64.65 
 
 		 1029 aa  1317    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0277  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  37.81 
 
 		 1043 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517386  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  56.81 
 
 		 1031 aa  1188    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.68 
 
 		 1046 aa  887    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1046 aa  890    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  47.65 
 
 		 1035 aa  929    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  42.91 
 
 		 1029 aa  796    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  40.83 
 
 		 1064 aa  772    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  38.14 
 
 		 1032 aa  691    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  40.33 
 
 		 1029 aa  665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  39.07 
 
 		 1037 aa  714    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  38.14 
 
 		 1022 aa  663    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  46.67 
 
 		 1045 aa  869    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  60.29 
 
 		 1038 aa  1187    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1047 aa  882    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2223  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux pump  38.21 
 
 		 1048 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  46.86 
 
 		 1035 aa  919    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  51.39 
 
 		 1041 aa  997    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  40.73 
 
 		 1037 aa  740    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  43.47 
 
 		 1024 aa  804    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1047 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  48.84 
 
 		 1028 aa  971    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  50.14 
 
 		 1048 aa  1006    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  42.42 
 
 		 1037 aa  835    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  46.45 
 
 		 1037 aa  909    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  100 
 
 		 1035 aa  2070    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  42.73 
 
 		 1022 aa  803    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  37.43 
 
 		 1049 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  39.47 
 
 		 1051 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  38.95 
 
 		 1051 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  45.97 
 
 		 1036 aa  903    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  57.66 
 
 		 1031 aa  1199    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  40.39 
 
 		 1051 aa  758    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4944  multidrug efflux protein  38.48 
 
 		 1018 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.978867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  50.76 
 
 		 1041 aa  992    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  56.42 
 
 		 1031 aa  1135    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  55.73 
 
 		 1046 aa  1125    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  41.4 
 
 		 1048 aa  706    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  53.73 
 
 		 1035 aa  1041    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  58.07 
 
 		 1030 aa  1209    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  57.68 
 
 		 1031 aa  1183    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  36.64 
 
 		 1012 aa  638    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  57.78 
 
 		 1034 aa  1207    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  76.71 
 
 		 1036 aa  1602    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  38.61 
 
 		 1024 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  38.49 
 
 		 1040 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  38.5 
 
 		 1026 aa  703    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  37.72 
 
 		 1030 aa  678    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  45.8 
 
 		 1023 aa  817    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.82 
 
 		 1068 aa  780    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1051 aa  880    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  57.39 
 
 		 1031 aa  1197    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1198  RND efflux transporter  37.86 
 
 		 1022 aa  657    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1051 aa  882    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  57.39 
 
 		 1031 aa  1197    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 		 1036 aa  696    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  50.2 
 
 		 1036 aa  970    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  46.67 
 
 		 1034 aa  935    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  50.68 
 
 		 1040 aa  995    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  56.61 
 
 		 1031 aa  1174    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  50.05 
 
 		 1038 aa  956    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56890  multidrug efflux protein  38.67 
 
 		 1018 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  47.75 
 
 		 1042 aa  909    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  38.54 
 
 		 1017 aa  652    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  56.71 
 
 		 1031 aa  1175    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  42.43 
 
 		 1025 aa  741    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1051 aa  879    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  57.39 
 
 		 1031 aa  1196    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  38.03 
 
 		 1044 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  59.37 
 
 		 1042 aa  1207    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  56.52 
 
 		 1031 aa  1173    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  54.38 
 
 		 1052 aa  1050    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  58.19 
 
 		 1034 aa  1192    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1047 aa  882    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  37.32 
 
 		 1026 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  45.68 
 
 		 1033 aa  896    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3678  acriflavin resistance protein  37.42 
 
 		 1027 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  37.51 
 
 		 1029 aa  634  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1611  acriflavin resistance protein  37.93 
 
 		 1028 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.921522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  37.45 
 
 		 1009 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  36.54 
 
 		 1012 aa  635  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  35.75 
 
 		 1044 aa  632  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  36.78 
 
 		 1019 aa  634  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  36.59 
 
 		 1019 aa  632  1e-180  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0906  multidrug efflux protein  37.28 
 
 		 1014 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1015 aa  628  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0945  multidrug efflux protein  37.18 
 
 		 1014 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  37.76 
 
 		 1029 aa  626  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  35.56 
 
 		 1037 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.500475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>