More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01076 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  54.02 
 
 		 1091 aa  1094    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2529  acriflavin resistance protein  39.55 
 
 		 1213 aa  719    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  53.25 
 
 		 1102 aa  1121    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  44.4 
 
 		 1173 aa  936    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  54.16 
 
 		 1085 aa  1098    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  52.94 
 
 		 1087 aa  1086    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  35.66 
 
 		 1050 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  52.51 
 
 		 1095 aa  1080    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  53.84 
 
 		 1082 aa  1118    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  53.98 
 
 		 1085 aa  1098    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  42.64 
 
 		 1166 aa  777    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  53.84 
 
 		 1087 aa  1101    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  54.16 
 
 		 1085 aa  1099    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  53.8 
 
 		 1083 aa  1099    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  53.2 
 
 		 1086 aa  1122    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  56.27 
 
 		 1156 aa  1222    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  54.07 
 
 		 1085 aa  1098    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1122 aa  2249    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  53.75 
 
 		 1087 aa  1099    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  53.75 
 
 		 1087 aa  1100    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.8 
 
 		 1081 aa  1090    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  53.06 
 
 		 1083 aa  1109    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  34 
 
 		 1044 aa  640    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  34.85 
 
 		 1043 aa  632  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  34.18 
 
 		 1034 aa  622  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1044 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  33.96 
 
 		 1043 aa  588  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.97 
 
 		 1034 aa  550  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  33.06 
 
 		 1023 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1027 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 		 1058 aa  502  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1027 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.5 
 
 		 1049 aa  494  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1038 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.61 
 
 		 1032 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1041 aa  465  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1041 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1039 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1087 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.35 
 
 		 1496 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 		 1041 aa  449  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1470 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1070 aa  446  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1051 aa  445  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.42 
 
 		 1071 aa  446  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1062 aa  445  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  31.19 
 
 		 1057 aa  446  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1036 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1073 aa  439  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1031 aa  439  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1095 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.93 
 
 		 1034 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1031 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  29.36 
 
 		 1031 aa  436  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 		 1070 aa  433  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1039 aa  430  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.36 
 
 		 1069 aa  428  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1022 aa  423  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 		 1048 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1053 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1075 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1047 aa  415  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  28.58 
 
 		 1042 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 		 1032 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1048 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  28.31 
 
 		 1040 aa  412  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1031 aa  412  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  28.26 
 
 		 1050 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 		 1028 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 		 1033 aa  410  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  42.04 
 
 		 1011 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1037 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  32 
 
 		 1084 aa  405  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2586  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 		 1061 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 		 1054 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1058 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3520  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1061 aa  406  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  28.7 
 
 		 1054 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1041 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1101 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1054 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1064 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.67 
 
 		 1068 aa  399  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1046 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1037 aa  393  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1038 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1066 aa  392  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1045 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1058 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 		 1034 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1022 aa  389  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  28.43 
 
 		 1070 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1042 aa  389  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1043 aa  390  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  28.43 
 
 		 1070 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  28.43 
 
 		 1070 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  28.43 
 
 		 1070 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1063 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1059 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1051 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>