More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1782 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1043 aa  2084    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  36.22 
 
 		 1146 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  36.15 
 
 		 1143 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  45.05 
 
 		 1092 aa  870    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  36.25 
 
 		 1057 aa  629  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  33.82 
 
 		 1134 aa  621  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  37.49 
 
 		 1048 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  32.69 
 
 		 1165 aa  599  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  37.95 
 
 		 1033 aa  598  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1191 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.69 
 
 		 1052 aa  584  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  36.18 
 
 		 1041 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1069 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 		 1038 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  33.93 
 
 		 1068 aa  568  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  34.48 
 
 		 1042 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  34.94 
 
 		 1045 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 1034 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1034 aa  547  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  34.72 
 
 		 1039 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1050 aa  532  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  33.78 
 
 		 1044 aa  531  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1043 aa  528  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1011 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1044 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  30.54 
 
 		 1024 aa  502  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1043 aa  495  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.64 
 
 		 1032 aa  492  1e-137  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1033 aa  487  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 		 1038 aa  486  1e-135  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1044 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1032 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1058 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1039 aa  483  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 		 1041 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1067 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1027 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1014 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.47 
 
 		 1496 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 		 1038 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1470 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1034 aa  469  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  29.22 
 
 		 1071 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1034 aa  466  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1040 aa  465  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 		 1063 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 		 1070 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1020 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 		 1041 aa  459  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  29.98 
 
 		 1069 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1033 aa  458  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1026 aa  456  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1028 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1028 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.45 
 
 		 1024 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1028 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1039 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.05 
 
 		 1049 aa  449  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.91 
 
 		 1036 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  46.84 
 
 		 1290 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.09 
 
 		 1036 aa  446  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.97 
 
 		 1025 aa  441  9.999999999999999e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1058 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1065 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  32.7 
 
 		 1024 aa  435  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1046 aa  436  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1029 aa  436  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 		 1028 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1095 aa  433  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1059 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1023 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1055 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1041 aa  428  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1038 aa  428  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1067 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1082 aa  425  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1028 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1017 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1173 aa  422  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1050 aa  423  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1014 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1051 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  28.43 
 
 		 1006 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1121 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1054 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1053 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.78 
 
 		 1027 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1047 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1054 aa  413  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 		 1101 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1028 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  27.39 
 
 		 1050 aa  412  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1046 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1044 aa  409  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1054 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1029 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1026 aa  409  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1066 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1058 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1026 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>