More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2569 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  100 
 
 		 1042 aa  2103    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  75.34 
 
 		 1034 aa  1583    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  38.94 
 
 		 1024 aa  785    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  75.36 
 
 		 1039 aa  1598    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  59.02 
 
 		 1052 aa  1234    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  38.1 
 
 		 1038 aa  770    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  48.4 
 
 		 1041 aa  948    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.3 
 
 		 1025 aa  640    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.6 
 
 		 1032 aa  768    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  48.69 
 
 		 1069 aa  1004    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  49.8 
 
 		 1048 aa  980    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  55.82 
 
 		 1038 aa  1138    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  37.28 
 
 		 1189 aa  728    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  58.5 
 
 		 1045 aa  1221    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  75.65 
 
 		 1044 aa  1584    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  42.7 
 
 		 1057 aa  855    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  44.85 
 
 		 1068 aa  898    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  41.4 
 
 		 1067 aa  775    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  44.81 
 
 		 1033 aa  869    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  34.91 
 
 		 1092 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  33.47 
 
 		 1043 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  35.3 
 
 		 1335 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  44.24 
 
 		 1267 aa  435  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  29.24 
 
 		 1143 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1146 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  29.83 
 
 		 1165 aa  422  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  28.79 
 
 		 1134 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1038 aa  343  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1050 aa  341  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.4 
 
 		 1011 aa  339  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1043 aa  338  3.9999999999999995e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1044 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1006 aa  329  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1050 aa  320  7.999999999999999e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1044 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1040 aa  318  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1034 aa  318  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1046 aa  317  8e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  28.66 
 
 		 1038 aa  317  8e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1038 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1034 aa  315  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1030 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  26.93 
 
 		 1052 aa  313  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.52 
 
 		 1034 aa  313  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  25.25 
 
 		 1047 aa  312  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1028 aa  311  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  38.07 
 
 		 1290 aa  310  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1470 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 		 1028 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.33 
 
 		 1024 aa  309  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  24.63 
 
 		 1032 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1042 aa  308  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.41 
 
 		 1031 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  25.63 
 
 		 1039 aa  308  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1031 aa  307  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1023 aa  307  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1033 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1028 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1031 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1031 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1026 aa  306  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1031 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1043 aa  304  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1055 aa  304  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  25.56 
 
 		 1048 aa  303  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  24.14 
 
 		 1014 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.93 
 
 		 1024 aa  303  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1022 aa  303  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1031 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.21 
 
 		 1031 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 		 1074 aa  302  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1031 aa  302  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1031 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.71 
 
 		 1034 aa  301  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.11 
 
 		 1024 aa  300  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  23.93 
 
 		 1071 aa  298  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1031 aa  297  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  25.91 
 
 		 1044 aa  297  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1032 aa  296  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1022 aa  296  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.44 
 
 		 1070 aa  295  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1020 aa  294  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  26.7 
 
 		 1042 aa  294  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1050 aa  293  9e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  24.73 
 
 		 1034 aa  293  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  25.29 
 
 		 1014 aa  293  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  23.71 
 
 		 1041 aa  291  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1054 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1054 aa  291  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1121 aa  291  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1067 aa  290  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  24.74 
 
 		 1036 aa  290  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1049 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  25.79 
 
 		 1054 aa  289  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  24.86 
 
 		 1034 aa  289  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1043 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1044 aa  288  4e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  23.7 
 
 		 1020 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1083 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1082 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>