More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2513 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  39.17 
 
 		 1165 aa  815    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  50.48 
 
 		 1143 aa  1150    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  100 
 
 		 1134 aa  2285    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  59.52 
 
 		 1124 aa  1321    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  50.44 
 
 		 1146 aa  1130    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  61.3 
 
 		 1191 aa  1395    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  34.24 
 
 		 1092 aa  612  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  33.93 
 
 		 1043 aa  599  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1069 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1068 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1057 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.98 
 
 		 1052 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1045 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 		 1011 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1038 aa  429  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.76 
 
 		 1050 aa  426  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  28.67 
 
 		 1039 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  30.12 
 
 		 1024 aa  417  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1044 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  29.4 
 
 		 1067 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  28.77 
 
 		 1042 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  38.5 
 
 		 1290 aa  413  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 		 1071 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.57 
 
 		 1032 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1033 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1063 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1059 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  29.22 
 
 		 1038 aa  399  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.84 
 
 		 1041 aa  400  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.55 
 
 		 1049 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1038 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  26.73 
 
 		 1028 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1058 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1020 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1028 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.84 
 
 		 1032 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1028 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 		 1496 aa  383  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1470 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.15 
 
 		 1039 aa  383  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.62 
 
 		 1025 aa  377  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1034 aa  377  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1065 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1043 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1095 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1044 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1028 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1020 aa  370  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1039 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.78 
 
 		 1069 aa  369  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1058 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1036 aa  366  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1053 aa  363  8e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.01 
 
 		 1034 aa  363  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1041 aa  363  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1267 aa  363  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1034 aa  362  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.99 
 
 		 1036 aa  360  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1043 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1070 aa  355  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 		 1014 aa  354  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1047 aa  353  7e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1088 aa  351  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1022 aa  347  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1075 aa  346  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  27.23 
 
 		 1066 aa  344  5e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.56 
 
 		 1024 aa  343  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1040 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1033 aa  342  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1044 aa  340  9e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1046 aa  340  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  26.32 
 
 		 1177 aa  339  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1026 aa  338  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1101 aa  338  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 		 1033 aa  337  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  25.09 
 
 		 1052 aa  335  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 		 1038 aa  336  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1103 aa  335  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1048 aa  335  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1048 aa  333  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  25.16 
 
 		 1030 aa  333  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25.55 
 
 		 1068 aa  333  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  25.64 
 
 		 1034 aa  331  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  24.96 
 
 		 1040 aa  330  8e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1031 aa  330  9e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1046 aa  330  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  24.28 
 
 		 1040 aa  329  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1054 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1121 aa  328  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1171 aa  327  6e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 		 1029 aa  327  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1054 aa  327  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.83 
 
 		 1041 aa  327  7e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.89 
 
 		 1024 aa  326  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1033 aa  325  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1033 aa  325  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1054 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1067 aa  323  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1052 aa  323  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1063 aa  322  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>