More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01960 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  38.66 
 
 		 1124 aa  777    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  40.35 
 
 		 1191 aa  861    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  39.17 
 
 		 1134 aa  815    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  38.93 
 
 		 1146 aa  779    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  100 
 
 		 1165 aa  2350    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  38.32 
 
 		 1143 aa  781    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 		 1092 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  32.51 
 
 		 1043 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1057 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1068 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  29.32 
 
 		 1024 aa  429  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.49 
 
 		 1052 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1045 aa  423  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  29.99 
 
 		 1042 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1069 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  31.35 
 
 		 1039 aa  412  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  30.06 
 
 		 1034 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 		 1189 aa  406  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1038 aa  396  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  40.37 
 
 		 1290 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1038 aa  384  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1267 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.46 
 
 		 1032 aa  377  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1067 aa  375  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 		 1043 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1041 aa  367  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1050 aa  365  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.47 
 
 		 1049 aa  364  4e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 1496 aa  364  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1011 aa  363  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  26.62 
 
 		 1040 aa  359  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1033 aa  357  5e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1032 aa  350  9e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1034 aa  349  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1044 aa  348  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1071 aa  347  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1058 aa  343  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1041 aa  343  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1034 aa  341  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1058 aa  340  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1038 aa  340  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1028 aa  340  9e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1033 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1039 aa  338  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1065 aa  337  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1028 aa  337  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  24.62 
 
 		 1020 aa  335  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1063 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.06 
 
 		 1470 aa  333  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1059 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1067 aa  327  6e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.41 
 
 		 1024 aa  325  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0455  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1105 aa  326  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1041 aa  326  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1017 aa  325  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1034 aa  323  9.000000000000001e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1054 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 		 1054 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1054 aa  320  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1027 aa  320  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 		 1036 aa  318  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1008 aa  317  9e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  24.52 
 
 		 1069 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26 
 
 		 1025 aa  315  1.9999999999999998e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1039 aa  315  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.87 
 
 		 1036 aa  315  3.9999999999999997e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1055 aa  314  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1026 aa  310  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1044 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1028 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  23.8 
 
 		 1095 aa  310  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  24.08 
 
 		 1014 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 		 1033 aa  306  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  24.28 
 
 		 1006 aa  306  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  24.38 
 
 		 1051 aa  305  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1023 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 		 1043 aa  303  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  24.24 
 
 		 1063 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4181  acriflavin resistance protein  25.19 
 
 		 1093 aa  303  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.644693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  24.16 
 
 		 1063 aa  302  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  24.16 
 
 		 1063 aa  301  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  24.16 
 
 		 1063 aa  301  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.62 
 
 		 1031 aa  301  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 		 1028 aa  301  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  24.84 
 
 		 1027 aa  301  6e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1035 aa  300  8e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  24.41 
 
 		 1022 aa  300  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 		 1031 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  23.9 
 
 		 1028 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  24.56 
 
 		 1053 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  24.16 
 
 		 1067 aa  298  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1029 aa  298  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.54 
 
 		 1034 aa  297  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 		 1031 aa  297  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  24.02 
 
 		 1067 aa  297  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1031 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  24.36 
 
 		 1050 aa  296  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  24.69 
 
 		 1068 aa  296  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1031 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  26.01 
 
 		 1052 aa  296  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>