More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1942 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  40.67 
 
 
1044 aa  776    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1040 aa  2060    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  40.43 
 
 
1050 aa  786    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  40.63 
 
 
1044 aa  767    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  49.37 
 
 
1034 aa  972    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  38.35 
 
 
1043 aa  726    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  39.88 
 
 
1043 aa  729    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  41 
 
 
1034 aa  773    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  41.65 
 
 
1011 aa  825    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 
1017 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  34.7 
 
 
1082 aa  624  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  34.78 
 
 
1083 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.71 
 
 
1081 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 
1086 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  37.16 
 
 
1027 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  35.32 
 
 
1087 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  35.47 
 
 
1087 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.92 
 
 
1049 aa  607  9.999999999999999e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  35.23 
 
 
1087 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 
1085 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  35.02 
 
 
1102 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 
1085 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  34.88 
 
 
1085 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  34.88 
 
 
1085 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 
1046 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.37 
 
 
1091 aa  601  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  35.56 
 
 
1023 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 
1083 aa  598  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  34.13 
 
 
1095 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 
1044 aa  582  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.66 
 
 
1024 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 
1028 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 
1026 aa  573  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  34.48 
 
 
1055 aa  574  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 
1041 aa  570  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  36.02 
 
 
1027 aa  572  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 
1032 aa  568  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  34.65 
 
 
1028 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  36.38 
 
 
1028 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  35.68 
 
 
1024 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 
1071 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 
1028 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  31.11 
 
 
1496 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 
1039 aa  552  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 
1058 aa  549  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 
1041 aa  549  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  30.53 
 
 
1173 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 
1050 aa  543  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 
1038 aa  545  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.04 
 
 
1070 aa  545  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 
1095 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 
1038 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  31 
 
 
1036 aa  535  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  34.48 
 
 
1028 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 
1065 aa  528  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 
1034 aa  529  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  32.06 
 
 
1039 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  30.58 
 
 
1069 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 
1041 aa  524  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 
1470 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 
1073 aa  520  1e-146  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  30.17 
 
 
1047 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 
1033 aa  521  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 
1062 aa  514  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 
1041 aa  512  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 
1058 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.44 
 
 
1058 aa  508  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 
1075 aa  509  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.27 
 
 
1050 aa  508  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 
1051 aa  503  1e-141  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30.58 
 
 
1036 aa  503  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 
1053 aa  506  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  31.21 
 
 
1071 aa  501  1e-140  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.96 
 
 
1024 aa  497  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 
1066 aa  499  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 
1048 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 
1040 aa  493  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 
1048 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  30.04 
 
 
1006 aa  488  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  30.39 
 
 
1088 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 
1033 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 
1022 aa  484  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 
1046 aa  485  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 
1033 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 
1063 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  27.8 
 
 
1040 aa  481  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 
1046 aa  482  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 
1059 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 
1088 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 
1088 aa  479  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 
1045 aa  479  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 
1057 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 
1031 aa  478  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  29.37 
 
 
1035 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 
1101 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 
1014 aa  474  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 
1022 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 
1031 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 
1177 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 
1044 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>