More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2518 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  87.11 
 
 		 1496 aa  1830    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  42.12 
 
 		 1038 aa  764    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  43.85 
 
 		 1071 aa  864    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  71.92 
 
 		 1470 aa  1532    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  41.91 
 
 		 1054 aa  759    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  41.59 
 
 		 1069 aa  805    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1041 aa  2076    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  75.97 
 
 		 1036 aa  1612    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.5 
 
 		 1050 aa  693    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  41.91 
 
 		 1054 aa  750    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  41.13 
 
 		 1055 aa  724    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  42.38 
 
 		 1066 aa  801    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  41.26 
 
 		 1095 aa  839    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  80.33 
 
 		 1032 aa  1716    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  41.77 
 
 		 1067 aa  767    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  42 
 
 		 1054 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  41.77 
 
 		 1065 aa  804    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  36.04 
 
 		 1062 aa  636    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  39.09 
 
 		 1028 aa  655    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  39.29 
 
 		 1028 aa  665    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  35.13 
 
 		 1034 aa  645    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  39.39 
 
 		 1028 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  57.96 
 
 		 1039 aa  1161    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  43.05 
 
 		 1033 aa  779    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  41.52 
 
 		 1070 aa  821    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 		 1075 aa  814    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 		 1028 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  37 
 
 		 1047 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1044 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 		 1033 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 		 1033 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  36.83 
 
 		 1035 aa  596  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 		 1044 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 		 1036 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1058 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  34.48 
 
 		 1011 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 		 1073 aa  590  1e-167  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  34.94 
 
 		 1405 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.91 
 
 		 1043 aa  588  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1031 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1031 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  34.25 
 
 		 1028 aa  582  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  35.24 
 
 		 1022 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  38.82 
 
 		 1045 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  38.8 
 
 		 1038 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1031 aa  567  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  34.69 
 
 		 1026 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  38.92 
 
 		 1044 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  34.46 
 
 		 1044 aa  568  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1034 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1035 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1053 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1031 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  34.34 
 
 		 1029 aa  559  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  33.05 
 
 		 1027 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  34.16 
 
 		 1036 aa  555  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1033 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1058 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1009 aa  547  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1048 aa  547  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.96 
 
 		 1043 aa  548  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1042 aa  549  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  34.58 
 
 		 1044 aa  548  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.47 
 
 		 1024 aa  544  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  33.84 
 
 		 1177 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1041 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  34.62 
 
 		 1025 aa  545  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1041 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1050 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 1042 aa  541  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.18 
 
 		 1032 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1044 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  33.02 
 
 		 1088 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 		 1048 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1032 aa  539  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.5 
 
 		 1050 aa  538  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1058 aa  537  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  34.27 
 
 		 1101 aa  535  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1058 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  32.83 
 
 		 1088 aa  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1032 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 		 1040 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  32.48 
 
 		 1027 aa  533  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1018 aa  536  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1027 aa  536  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.06 
 
 		 1049 aa  532  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 		 1023 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1037 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1041 aa  532  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  32.99 
 
 		 1063 aa  532  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1051 aa  529  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1040 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  32.83 
 
 		 1171 aa  531  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1043 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1014 aa  530  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1034 aa  529  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  32.02 
 
 		 1036 aa  527  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1029 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 		 1042 aa  527  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.24 
 
 		 1024 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>