More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2950 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  44.26 
 
 		 1043 aa  848    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  38.65 
 
 		 1034 aa  731    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  42.54 
 
 		 1043 aa  801    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  44.68 
 
 		 1050 aa  895    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  45.06 
 
 		 1011 aa  875    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1044 aa  2082    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  38.7 
 
 		 1041 aa  699    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  40.15 
 
 		 1040 aa  746    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  44.27 
 
 		 1034 aa  889    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  76.53 
 
 		 1044 aa  1619    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.13 
 
 		 1081 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  37.7 
 
 		 1046 aa  634  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  35.94 
 
 		 1038 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  35.84 
 
 		 1023 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  37.03 
 
 		 1083 aa  627  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  36.23 
 
 		 1039 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  35.62 
 
 		 1082 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  34.81 
 
 		 1470 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  34.03 
 
 		 1032 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  36.76 
 
 		 1083 aa  611  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  35.85 
 
 		 1055 aa  608  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  36.41 
 
 		 1086 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  38.1 
 
 		 1026 aa  608  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 		 1085 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 		 1085 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 		 1085 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  36.48 
 
 		 1085 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 		 1087 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 		 1087 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  38.97 
 
 		 1028 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  33.75 
 
 		 1496 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  36.21 
 
 		 1102 aa  601  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  36.84 
 
 		 1087 aa  601  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.14 
 
 		 1122 aa  602  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  36.62 
 
 		 1087 aa  602  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.4 
 
 		 1091 aa  598  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  34.48 
 
 		 1041 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  37.85 
 
 		 1027 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1071 aa  592  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  36.36 
 
 		 1095 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.67 
 
 		 1049 aa  586  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1017 aa  588  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  33.68 
 
 		 1036 aa  586  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  34.65 
 
 		 1044 aa  585  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.82 
 
 		 1024 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 		 1050 aa  585  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 		 1058 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 		 1173 aa  567  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  34.94 
 
 		 1028 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1095 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  35.82 
 
 		 1027 aa  569  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  35.42 
 
 		 1024 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  33.86 
 
 		 1041 aa  559  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  34.94 
 
 		 1028 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1070 aa  555  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1065 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  33.71 
 
 		 1069 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 		 1038 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1034 aa  538  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  33.96 
 
 		 1075 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.26 
 
 		 1050 aa  536  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1058 aa  532  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1047 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  34.3 
 
 		 1066 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 		 1033 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1006 aa  524  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  31.6 
 
 		 1036 aa  523  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1041 aa  526  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1062 aa  522  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1028 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1051 aa  519  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  34.63 
 
 		 1028 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 		 1039 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1045 aa  515  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1054 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.09 
 
 		 1058 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1040 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1054 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.53 
 
 		 1053 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1046 aa  511  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1022 aa  509  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1054 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1059 aa  508  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1044 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1063 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1014 aa  496  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1073 aa  492  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1067 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1055 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 		 1057 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  30.41 
 
 		 1071 aa  486  1e-135  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1031 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  30.44 
 
 		 1048 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 		 1026 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1049 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1027 aa  478  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1087 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1035 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  30.08 
 
 		 1040 aa  467  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>