More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4164 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  53.93 
 
 		 1049 aa  1054    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  45.84 
 
 		 1036 aa  904    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  35.55 
 
 		 1050 aa  636    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  62.51 
 
 		 1039 aa  1309    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  45.09 
 
 		 1058 aa  903    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  60.56 
 
 		 1050 aa  1268    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  45.77 
 
 		 1058 aa  929    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  48.42 
 
 		 1063 aa  977    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  45.74 
 
 		 1053 aa  954    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  45.65 
 
 		 1048 aa  911    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  46.57 
 
 		 1041 aa  942    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  45.57 
 
 		 1046 aa  878    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  49.62 
 
 		 1059 aa  1009    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1040 aa  2083    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  47.58 
 
 		 1034 aa  960    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  55.41 
 
 		 1055 aa  1166    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  34.26 
 
 		 1034 aa  623  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.97 
 
 		 1024 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  36.08 
 
 		 1028 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 		 1058 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1043 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  36.33 
 
 		 1028 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1011 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1470 aa  602  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 		 1039 aa  596  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1028 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1038 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1055 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  33.53 
 
 		 1496 aa  581  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.59 
 
 		 1043 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  35.5 
 
 		 1028 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  33.12 
 
 		 1070 aa  575  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1033 aa  569  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1044 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1034 aa  564  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1032 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 		 1036 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 		 1041 aa  552  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1095 aa  548  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1065 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1071 aa  545  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1054 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.96 
 
 		 1069 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.89 
 
 		 1054 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1044 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1054 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.22 
 
 		 1024 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1047 aa  539  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1027 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.13 
 
 		 1049 aa  530  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1066 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1064 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1009 aa  524  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1062 aa  523  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1067 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1051 aa  522  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1024 aa  521  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1075 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1045 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 		 1046 aa  516  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 		 1023 aa  515  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1051 aa  514  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1038 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1040 aa  510  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  33.63 
 
 		 1044 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1026 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1048 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1031 aa  502  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1023 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  32.47 
 
 		 1035 aa  499  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1037 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1022 aa  500  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1101 aa  500  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1040 aa  502  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  33.88 
 
 		 1028 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1025 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1022 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 		 1171 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  29.97 
 
 		 1177 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  31.44 
 
 		 1050 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1044 aa  490  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1027 aa  490  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1044 aa  489  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  31.24 
 
 		 1026 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1035 aa  489  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 		 1042 aa  489  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1033 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 		 1026 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1058 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1041 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1046 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 		 1017 aa  486  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1030 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  30.51 
 
 		 1042 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1060 aa  483  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1040 aa  480  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1036 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  32.29 
 
 		 1030 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  31.14 
 
 		 1068 aa  483  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.66 
 
 		 1031 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>