More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2783 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  41.79 
 
 
1028 aa  649    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  97.41 
 
 
1044 aa  1850    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  95.59 
 
 
1038 aa  1809    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1045 aa  2048    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  37.62 
 
 
1038 aa  653    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  41.78 
 
 
1028 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  41.11 
 
 
1039 aa  658    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  40.98 
 
 
1055 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  38.38 
 
 
1496 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  40.12 
 
 
1028 aa  622  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  39.26 
 
 
1470 aa  619  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  37.83 
 
 
1032 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  38.45 
 
 
1047 aa  605  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  38.73 
 
 
1041 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  37.21 
 
 
1071 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 
1011 aa  597  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  36.77 
 
 
1065 aa  598  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  35.05 
 
 
1050 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  37.85 
 
 
1036 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  40.63 
 
 
1028 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 
1095 aa  581  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 
1075 aa  575  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  34.66 
 
 
1036 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  36.84 
 
 
1069 aa  572  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 
1043 aa  571  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  39.02 
 
 
1067 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 
1070 aa  568  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  36.45 
 
 
1066 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 
1044 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  38.43 
 
 
1033 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  38.62 
 
 
1054 aa  559  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 
1034 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  38.62 
 
 
1054 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.17 
 
 
1049 aa  555  1e-156  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 
1034 aa  550  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  38.43 
 
 
1054 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 
1058 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 
1058 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  35.77 
 
 
1036 aa  542  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 
1041 aa  542  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  30.51 
 
 
1058 aa  541  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  33.54 
 
 
1171 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 
1063 aa  538  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.77 
 
 
1024 aa  538  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  33.6 
 
 
1177 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 
1059 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 
1009 aa  538  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 
1053 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 
1044 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  36.64 
 
 
1017 aa  532  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 
1043 aa  532  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  35.93 
 
 
1028 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  35.13 
 
 
1031 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 
1046 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  34.29 
 
 
1062 aa  526  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  35.27 
 
 
1044 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  32.45 
 
 
1022 aa  524  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  30.56 
 
 
1050 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  35.67 
 
 
1031 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 
1039 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 
1046 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  35.67 
 
 
1031 aa  522  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 
1040 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  35.66 
 
 
1031 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 
1101 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 
1048 aa  516  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 
1018 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  32.13 
 
 
1013 aa  509  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  34.74 
 
 
1029 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 
1048 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  34.72 
 
 
1039 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  35.6 
 
 
1027 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 
1037 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  35.03 
 
 
1035 aa  508  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 
1048 aa  506  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 
1073 aa  503  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 
1014 aa  503  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 
1037 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 
1037 aa  506  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 
1037 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 
1055 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.23 
 
 
1024 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 
1027 aa  500  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  34.53 
 
 
1031 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  35.66 
 
 
1027 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 
1083 aa  502  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  33.69 
 
 
1036 aa  499  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 
1058 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  33.94 
 
 
1036 aa  498  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  33.74 
 
 
1088 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 
1049 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  32.51 
 
 
1042 aa  496  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  35.78 
 
 
1028 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 
1042 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3464  Acr family transporter  33.4 
 
 
1101 aa  495  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 
1044 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4034  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 
1037 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 
1040 aa  492  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 
1032 aa  490  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  34.93 
 
 
1036 aa  493  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>