More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2109 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1044 aa  2087    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 
1044 aa  658    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  47.7 
 
 
1038 aa  990    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  37.9 
 
 
1011 aa  655    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  62.35 
 
 
1050 aa  1258    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  60 
 
 
1046 aa  1288    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 
1043 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 
1050 aa  602  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  34.83 
 
 
1034 aa  592  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  34.65 
 
 
1044 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 
1040 aa  568  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 
1034 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  34.62 
 
 
1027 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 
1024 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.34 
 
 
1043 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.16 
 
 
1049 aa  544  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 
1017 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 
1023 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 
1082 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 
1028 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.63 
 
 
1024 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 
1055 aa  503  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 
1086 aa  506  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.54 
 
 
1081 aa  503  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 
1026 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 
1083 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 
1006 aa  488  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.73 
 
 
1091 aa  486  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 
1085 aa  486  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 
1087 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 
1087 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 
1087 aa  485  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 
1085 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 
1027 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  31.19 
 
 
1085 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 
1102 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 
1173 aa  479  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  31.19 
 
 
1083 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 
1058 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  31.19 
 
 
1085 aa  479  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 
1053 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 
1063 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  31.56 
 
 
1071 aa  470  1.0000000000000001e-131  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 
1059 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 
1041 aa  469  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 
1038 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 
1039 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 
1058 aa  465  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 
1034 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  30.58 
 
 
1050 aa  462  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 
1040 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 
1048 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 
1071 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 
1041 aa  456  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 
1041 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 
1470 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 
1058 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 
1039 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 
1032 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 
1022 aa  446  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.24 
 
 
1036 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 
1049 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 
1041 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.7 
 
 
1069 aa  436  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 
1070 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 
1073 aa  431  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.4 
 
 
1496 aa  429  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 
1095 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 
1047 aa  428  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 
1171 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  28.33 
 
 
1177 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 
1101 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 
1055 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 
1046 aa  421  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 
1045 aa  423  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.28 
 
 
1024 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 
1036 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 
1038 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  30 
 
 
1026 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  29.83 
 
 
1064 aa  416  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 
1048 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 
1031 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0545  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 
1008 aa  413  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000592729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 
1044 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 
1028 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 
1062 aa  410  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  28.86 
 
 
1039 aa  409  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0559  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 
1000 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0052837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 
1065 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.27 
 
 
1031 aa  405  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 
1028 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 
1014 aa  403  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.94 
 
 
1068 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 
1031 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 
1031 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 
1031 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 
1033 aa  406  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  26.86 
 
 
1060 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 
1066 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 
1026 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.643434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>