More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0545 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0559  acriflavin resistance protein  99.7 
 
 		 1000 aa  1995    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0052837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0545  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1008 aa  2019    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000592729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1011 aa  512  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1050 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1043 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1023 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1034 aa  458  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1041 aa  448  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 		 1044 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 		 1044 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1034 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 		 1044 aa  422  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1046 aa  404  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1043 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 		 1040 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1027 aa  386  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1024 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.95 
 
 		 1496 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1050 aa  381  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1173 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1074 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.8 
 
 		 1024 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1038 aa  373  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  30.34 
 
 		 1065 aa  370  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1028 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  30.18 
 
 		 1064 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 		 1041 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1039 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 		 1104 aa  365  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1045 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1016 aa  362  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1032 aa  360  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1051 aa  360  7e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  27.36 
 
 		 1050 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1039 aa  358  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1038 aa  357  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  27.43 
 
 		 1058 aa  356  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  27.27 
 
 		 1044 aa  353  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1017 aa  353  8.999999999999999e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.18 
 
 		 1069 aa  352  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1097 aa  352  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1058 aa  351  5e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1058 aa  349  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1067 aa  348  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1015 aa  346  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1470 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1026 aa  344  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1055 aa  344  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1089 aa  343  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1059 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1063 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1070 aa  341  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1027 aa  341  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0304  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1028 aa  341  5e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.99394  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  29.79 
 
 		 1062 aa  340  5.9999999999999996e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  28.66 
 
 		 1102 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1028 aa  340  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1041 aa  339  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1036 aa  338  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 		 1026 aa  337  7.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1028 aa  337  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 1029 aa  335  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1006 aa  334  6e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1075 aa  333  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1054 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1044 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.23 
 
 		 1024 aa  331  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1054 aa  331  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  26.37 
 
 		 1004 aa  330  7e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1087 aa  330  7e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1034 aa  330  9e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1095 aa  329  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1048 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.94 
 
 		 1051 aa  328  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1028 aa  328  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.28 
 
 		 1049 aa  327  6e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1029 aa  325  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1022 aa  325  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1057 aa  325  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1055 aa  325  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 		 1054 aa  324  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1055 aa  325  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1087 aa  324  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1041 aa  324  6e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1031 aa  323  9.000000000000001e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1055 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 		 1072 aa  322  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1065 aa  320  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  27.8 
 
 		 1014 aa  320  7e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1047 aa  320  7e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1048 aa  320  7e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.25 
 
 		 1014 aa  318  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1075 aa  317  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1053 aa  317  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  28.49 
 
 		 1038 aa  317  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  27.46 
 
 		 1014 aa  316  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1040 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1043 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.85 
 
 		 1014 aa  315  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1038 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>