More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1418 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  100 
 
 		 1004 aa  1986    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1074 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  32.49 
 
 		 1064 aa  482  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1050 aa  482  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1097 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  33.94 
 
 		 1104 aa  479  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  33.71 
 
 		 1062 aa  476  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 		 1065 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  33 
 
 		 1089 aa  475  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.05 
 
 		 1044 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1034 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  32.77 
 
 		 1072 aa  469  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 		 1011 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1075 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1028 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.64 
 
 		 1039 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.76 
 
 		 1038 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  30.67 
 
 		 1038 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1038 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1039 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.76 
 
 		 1038 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.1 
 
 		 1038 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  32.39 
 
 		 1077 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.67 
 
 		 1038 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.76 
 
 		 1038 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.88 
 
 		 1038 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1023 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1038 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1067 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1015 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  35.2 
 
 		 1263 aa  432  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1016 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  30.53 
 
 		 1043 aa  432  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 		 1044 aa  429  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1040 aa  422  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  30.6 
 
 		 1121 aa  423  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1043 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  35.57 
 
 		 1089 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  28.51 
 
 		 1055 aa  405  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  28.51 
 
 		 1055 aa  405  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.03 
 
 		 1014 aa  406  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.53 
 
 		 1051 aa  398  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 		 1014 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.34 
 
 		 1014 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1014 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.34 
 
 		 1014 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.2 
 
 		 1496 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1028 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1014 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 		 1041 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1041 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.51 
 
 		 1014 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1051 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.44 
 
 		 980 aa  390  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.34 
 
 		 1014 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1038 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1032 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 		 1039 aa  382  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  27.23 
 
 		 1053 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1470 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1034 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.03 
 
 		 955 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1028 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1070 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1028 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1040 aa  365  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1036 aa  365  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1055 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  25.75 
 
 		 1041 aa  361  4e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1095 aa  359  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1039 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1046 aa  357  6.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1048 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1055 aa  354  5.9999999999999994e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1075 aa  353  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  28.59 
 
 		 1033 aa  352  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27 
 
 		 1024 aa  351  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1058 aa  350  8e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1054 aa  350  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1041 aa  349  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1054 aa  349  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  26.98 
 
 		 1066 aa  348  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1058 aa  348  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.6 
 
 		 1071 aa  348  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1027 aa  347  8.999999999999999e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1065 aa  345  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.68 
 
 		 1036 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1054 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1058 aa  343  7e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  27.74 
 
 		 1050 aa  343  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1059 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1067 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.32 
 
 		 1069 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.64 
 
 		 1063 aa  337  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  27.73 
 
 		 1028 aa  336  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1029 aa  335  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.02 
 
 		 1024 aa  334  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1026 aa  332  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  28.46 
 
 		 1071 aa  332  2e-89  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1034 aa  332  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>