More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02800 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  43.96 
 
 		 1097 aa  705    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  100 
 
 		 1121 aa  2187    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  45.27 
 
 		 1089 aa  758    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  45.96 
 
 		 1064 aa  764    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  47.57 
 
 		 1075 aa  828    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  44.42 
 
 		 1067 aa  715    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  44.09 
 
 		 1062 aa  721    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  47.11 
 
 		 1089 aa  778    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  44.07 
 
 		 1104 aa  749    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  47.47 
 
 		 1072 aa  836    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  46.1 
 
 		 1077 aa  752    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  43.13 
 
 		 1065 aa  739    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  45.89 
 
 		 1074 aa  819    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  48.58 
 
 		 1040 aa  734    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  41.34 
 
 		 1028 aa  632  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  44.27 
 
 		 1028 aa  622  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  32.89 
 
 		 1016 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.34 
 
 		 1039 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.43 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  34.43 
 
 		 1038 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  34.47 
 
 		 1038 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.43 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.43 
 
 		 1038 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.43 
 
 		 1038 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.62 
 
 		 1038 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.34 
 
 		 1038 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 		 1038 aa  503  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 		 1039 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 		 1015 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1011 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  32.47 
 
 		 1023 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1055 aa  455  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1055 aa  455  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.91 
 
 		 1051 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1043 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  30.71 
 
 		 1004 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 		 1044 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  38.1 
 
 		 1263 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.25 
 
 		 1014 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.35 
 
 		 1053 aa  433  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1043 aa  431  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1044 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.76 
 
 		 1055 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.03 
 
 		 1034 aa  419  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1050 aa  416  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1048 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1058 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.76 
 
 		 1014 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 		 1014 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 		 1014 aa  412  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.76 
 
 		 1014 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.94 
 
 		 980 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.8 
 
 		 1014 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1014 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1063 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.37 
 
 		 1049 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1034 aa  399  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.73 
 
 		 1014 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.47 
 
 		 1036 aa  395  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1058 aa  393  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1041 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1040 aa  390  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1028 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  30.76 
 
 		 1028 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1039 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1034 aa  379  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 		 1038 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1059 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.18 
 
 		 1039 aa  379  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.73 
 
 		 955 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  29.35 
 
 		 1055 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2104  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  27.53 
 
 		 1034 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1041 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1761  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 		 1034 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  27.68 
 
 		 1050 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1041 aa  366  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 		 1046 aa  365  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 		 1040 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1046 aa  364  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1006 aa  362  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  29.27 
 
 		 1082 aa  360  6e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 		 1086 aa  357  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 		 1024 aa  357  8.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1051 aa  356  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 		 1087 aa  354  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.44 
 
 		 1069 aa  353  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1065 aa  352  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.01 
 
 		 1024 aa  351  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.17 
 
 		 1031 aa  348  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1044 aa  348  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1031 aa  348  5e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1102 aa  346  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.45 
 
 		 1095 aa  346  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1070 aa  345  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1032 aa  344  4e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  28.87 
 
 		 1028 aa  344  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 		 1042 aa  343  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.04 
 
 		 1071 aa  343  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1031 aa  343  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  27.75 
 
 		 1036 aa  343  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>