More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2287 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  47.11 
 
 
1028 aa  701    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  47.49 
 
 
1028 aa  780    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  49 
 
 
1065 aa  873    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  48.95 
 
 
1104 aa  808    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  46.18 
 
 
1064 aa  815    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  41.79 
 
 
1067 aa  703    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  52.16 
 
 
1089 aa  905    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  48.41 
 
 
1062 aa  844    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  50.43 
 
 
1040 aa  822    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  47.47 
 
 
1121 aa  833    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1075 aa  2100    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  47.97 
 
 
1097 aa  774    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  44.76 
 
 
1074 aa  823    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  48.47 
 
 
1089 aa  844    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  87.47 
 
 
1072 aa  1795    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  54.5 
 
 
1077 aa  941    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 
1016 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 
1015 aa  505  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 
1050 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 
1043 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  32 
 
 
1023 aa  479  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  32.42 
 
 
1004 aa  476  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.47 
 
 
1034 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.51 
 
 
1038 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  31.51 
 
 
1038 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  31.51 
 
 
1038 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.42 
 
 
1038 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.51 
 
 
1038 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.51 
 
 
1038 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 
1044 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.42 
 
 
1038 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.23 
 
 
1038 aa  459  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.3 
 
 
1039 aa  458  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 
1038 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 
1039 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 
1055 aa  449  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 
1055 aa  449  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  37.31 
 
 
1263 aa  448  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.38 
 
 
1051 aa  442  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 
1043 aa  442  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 
1044 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 
1011 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 
1039 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 
1053 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.91 
 
 
1014 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.75 
 
 
1049 aa  422  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 
1014 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 
1017 aa  422  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 
1055 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.76 
 
 
1014 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.76 
 
 
1014 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 
1173 aa  419  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 
1039 aa  419  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 
1014 aa  416  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.1 
 
 
1014 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 
1026 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 
1095 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 
1082 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  30.49 
 
 
1014 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.4 
 
 
1036 aa  405  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 
1014 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 
1034 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 
1046 aa  404  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 
1027 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.9 
 
 
1069 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 
1070 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 
1071 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 
1075 aa  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.24 
 
 
980 aa  392  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 
1055 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 
1040 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  28 
 
 
1044 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 
1048 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  30.71 
 
 
1054 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2104  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  28 
 
 
1034 aa  386  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.54 
 
 
1024 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 
1028 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1761  acriflavin resistance protein  28 
 
 
1034 aa  386  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 
1034 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 
1024 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 
1022 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.43 
 
 
955 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 
1470 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  30.71 
 
 
1054 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  28.88 
 
 
1043 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  27.7 
 
 
1050 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 
1046 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.08 
 
 
1049 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 
1041 aa  377  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 
1063 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 
1028 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  28.83 
 
 
1075 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 
1059 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 
1006 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 
1038 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.48 
 
 
1496 aa  376  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 
1058 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 
1054 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 
1067 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 
1047 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>