More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3171 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  51.1 
 
 		 1028 aa  845    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  44.8 
 
 		 1075 aa  802    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  61 
 
 		 1089 aa  1171    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  49.38 
 
 		 1040 aa  819    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  46.8 
 
 		 1028 aa  820    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  50.38 
 
 		 1064 aa  944    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  51.2 
 
 		 1097 aa  909    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  58.5 
 
 		 1065 aa  1155    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1074 aa  2112    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  51.1 
 
 		 1104 aa  962    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  42.52 
 
 		 1077 aa  696    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  47.56 
 
 		 1062 aa  857    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  44.35 
 
 		 1089 aa  756    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  44.55 
 
 		 1072 aa  814    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  45.74 
 
 		 1121 aa  818    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  45.96 
 
 		 1067 aa  833    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 		 1016 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  35.79 
 
 		 1038 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  35.11 
 
 		 1015 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  35.69 
 
 		 1038 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  35.51 
 
 		 1038 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.57 
 
 		 1039 aa  535  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.32 
 
 		 1038 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  35.32 
 
 		 1038 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  35.32 
 
 		 1038 aa  535  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.32 
 
 		 1038 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  35.69 
 
 		 1038 aa  535  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  35.08 
 
 		 1039 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  35.13 
 
 		 1038 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1050 aa  526  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  32.16 
 
 		 1004 aa  503  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  32.96 
 
 		 1055 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  32.96 
 
 		 1055 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  32.36 
 
 		 1014 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1044 aa  502  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 		 1034 aa  502  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  38.11 
 
 		 1263 aa  498  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1023 aa  493  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  32.18 
 
 		 1014 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1014 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  32.18 
 
 		 1014 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1043 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.89 
 
 		 1014 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1014 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.17 
 
 		 1051 aa  478  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 		 1014 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1011 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.66 
 
 		 1014 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  32.33 
 
 		 980 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1044 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.19 
 
 		 1053 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 		 1043 aa  456  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  32.14 
 
 		 955 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1040 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1063 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1058 aa  435  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1027 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.61 
 
 		 1024 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 		 1046 aa  432  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 		 1041 aa  432  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1048 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1048 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1058 aa  429  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1034 aa  429  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.49 
 
 		 1496 aa  425  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.52 
 
 		 1036 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1055 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1039 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1059 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1034 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1041 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.95 
 
 		 1049 aa  415  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1040 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1038 aa  413  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1041 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1470 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  28.72 
 
 		 1050 aa  412  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  29.03 
 
 		 1173 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  29.01 
 
 		 1083 aa  413  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1017 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1058 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1041 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1055 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1032 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1038 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 		 1044 aa  398  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1051 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1071 aa  396  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  29.06 
 
 		 1045 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1028 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1065 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1095 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1035 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1028 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.05 
 
 		 1069 aa  393  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1070 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1050 aa  393  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1092 aa  390  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0545  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1008 aa  389  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000592729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0559  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1000 aa  389  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0052837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>