More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1637 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  44.07 
 
 		 1087 aa  872    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  81.17 
 
 		 1166 aa  1597    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  45.66 
 
 		 1091 aa  887    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  46.11 
 
 		 1085 aa  898    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  46.11 
 
 		 1085 aa  898    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  44.09 
 
 		 1102 aa  891    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  34.99 
 
 		 1011 aa  652    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  45.94 
 
 		 1085 aa  894    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  45.96 
 
 		 1083 aa  897    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  44.62 
 
 		 1086 aa  890    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  43.74 
 
 		 1095 aa  866    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  46.02 
 
 		 1085 aa  896    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  43.41 
 
 		 1156 aa  881    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  45.84 
 
 		 1087 aa  892    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  45.93 
 
 		 1087 aa  891    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  44.5 
 
 		 1083 aa  908    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  43.16 
 
 		 1082 aa  890    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  46.02 
 
 		 1087 aa  894    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.72 
 
 		 1081 aa  877    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.31 
 
 		 1122 aa  917    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1173 aa  2335    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  34.74 
 
 		 1043 aa  626  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.03 
 
 		 1050 aa  628  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1034 aa  619  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1044 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.05 
 
 		 1043 aa  586  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 		 1044 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 		 1040 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1034 aa  530  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  30.76 
 
 		 1046 aa  530  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1055 aa  527  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1017 aa  526  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1058 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1023 aa  515  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1470 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1087 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  32.61 
 
 		 1028 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 		 1028 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1041 aa  502  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1027 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 		 1032 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  30.15 
 
 		 1496 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 		 1071 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  28.97 
 
 		 1044 aa  496  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1024 aa  495  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1039 aa  492  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 		 1095 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  30.32 
 
 		 1069 aa  486  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1053 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.85 
 
 		 1024 aa  475  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1026 aa  476  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1038 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1070 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1036 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 		 1041 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1048 aa  465  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.85 
 
 		 1049 aa  460  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1028 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1062 aa  458  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2529  acriflavin resistance protein  41.2 
 
 		 1213 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 		 1034 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1066 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.96 
 
 		 1033 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1029 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 		 1073 aa  443  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1039 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  30.99 
 
 		 1038 aa  445  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  28.58 
 
 		 1065 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.12 
 
 		 1036 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1038 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1075 aa  443  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1048 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 		 1058 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1070 aa  439  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 1046 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.07 
 
 		 1024 aa  436  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  27.65 
 
 		 1041 aa  435  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1045 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1057 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1059 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1044 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 		 1036 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1079 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  30.71 
 
 		 1064 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  29.27 
 
 		 1022 aa  425  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1030 aa  426  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  27.91 
 
 		 1040 aa  423  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3520  acriflavin resistance protein  30.12 
 
 		 1061 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 		 1101 aa  422  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2586  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 		 1061 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  28.61 
 
 		 1050 aa  422  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  28.91 
 
 		 1040 aa  423  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1009 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.81 
 
 		 1068 aa  419  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5557  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.12 
 
 		 1032 aa  419  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  28.58 
 
 		 1034 aa  416  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  27.43 
 
 		 1013 aa  415  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1031 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1031 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1031 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>