More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0763 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  58.81 
 
 
1496 aa  1206    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  39.06 
 
 
1047 aa  667    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  41.35 
 
 
1028 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  41.24 
 
 
1028 aa  686    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  45 
 
 
1071 aa  869    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  43.77 
 
 
1067 aa  779    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  43.93 
 
 
1069 aa  852    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  57.96 
 
 
1041 aa  1159    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  56.85 
 
 
1032 aa  1171    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.78 
 
 
1050 aa  679    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  43.7 
 
 
1054 aa  780    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  40.59 
 
 
1028 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  36.28 
 
 
1062 aa  660    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  43.07 
 
 
1066 aa  813    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  41.78 
 
 
1095 aa  843    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  43.17 
 
 
1055 aa  766    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  41.11 
 
 
1028 aa  707    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  44.74 
 
 
1065 aa  833    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 
1075 aa  798    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  59.33 
 
 
1470 aa  1195    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  42.76 
 
 
1070 aa  829    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  45.4 
 
 
1038 aa  821    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1039 aa  2062    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  43.6 
 
 
1054 aa  785    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  43.6 
 
 
1054 aa  785    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  44.5 
 
 
1033 aa  795    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  58.08 
 
 
1036 aa  1155    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  41.03 
 
 
1038 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  41.32 
 
 
1045 aa  635  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 
1044 aa  625  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  41.12 
 
 
1044 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  36.23 
 
 
1044 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  37.29 
 
 
1035 aa  614  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  35.61 
 
 
1011 aa  612  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  35.36 
 
 
1036 aa  612  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  36.4 
 
 
1031 aa  599  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  36.4 
 
 
1031 aa  598  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  36.33 
 
 
1043 aa  596  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  34.24 
 
 
1058 aa  592  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 
1034 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  35.07 
 
 
1044 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  36.39 
 
 
1026 aa  588  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  35.41 
 
 
1028 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 
1048 aa  585  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  32.12 
 
 
1058 aa  582  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  32.64 
 
 
1058 aa  579  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 
1063 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  34.59 
 
 
1031 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 
1073 aa  577  1.0000000000000001e-163  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 
1033 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 
1033 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  35.71 
 
 
1405 aa  568  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 
1029 aa  568  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  32.79 
 
 
1039 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  35.2 
 
 
1041 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  34.63 
 
 
1027 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.88 
 
 
1024 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.37 
 
 
1050 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.41 
 
 
1049 aa  561  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 
1053 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  34.44 
 
 
1044 aa  560  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  32.47 
 
 
1059 aa  559  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.76 
 
 
1024 aa  558  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 
1040 aa  558  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 
1033 aa  559  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 
1031 aa  556  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 
1034 aa  558  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 
1043 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 
1009 aa  552  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 
1101 aa  554  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 
1050 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  34.37 
 
 
1037 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 
1042 aa  549  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  34.32 
 
 
1044 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 
1022 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  35.32 
 
 
1048 aa  545  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  35.47 
 
 
1025 aa  545  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  32.82 
 
 
1013 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  32.25 
 
 
1042 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 
1040 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  33.62 
 
 
1068 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  34.29 
 
 
1031 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 
1014 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  34.02 
 
 
1103 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  35 
 
 
1043 aa  538  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 
1034 aa  537  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 
1040 aa  538  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 
1022 aa  538  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 
1032 aa  538  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 
1039 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  31.8 
 
 
1036 aa  534  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  33.21 
 
 
1088 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4034  acriflavin resistance protein  34.37 
 
 
1037 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 
1035 aa  535  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 
1032 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  32.93 
 
 
1088 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 
1055 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 
1088 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  34.67 
 
 
1042 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 
1048 aa  535  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>