More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2544 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1087 aa  2145    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  65 
 
 		 1084 aa  1263    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  69.59 
 
 		 1079 aa  1433    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  74.61 
 
 		 1070 aa  1588    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  72.44 
 
 		 1069 aa  1525    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3520  acriflavin resistance protein  71.36 
 
 		 1061 aa  1463    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2586  acriflavin resistance protein  71.36 
 
 		 1061 aa  1463    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  38.08 
 
 		 1057 aa  618  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 		 1044 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1011 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3831  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1024 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2346  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1024 aa  486  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  hitchhiker  0.00300678 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1173 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 		 1043 aa  473  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1050 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1034 aa  463  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 		 1082 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 		 1023 aa  452  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1044 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1102 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1043 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1085 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 		 1085 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 		 1086 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1034 aa  429  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  29.4 
 
 		 1087 aa  428  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1024 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1038 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1083 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.9 
 
 		 1081 aa  426  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1040 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.15 
 
 		 1122 aa  422  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.02 
 
 		 1091 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1095 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1046 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1087 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1087 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1087 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.77 
 
 		 1049 aa  412  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1026 aa  412  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  28.96 
 
 		 1053 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1032 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1041 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1027 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1470 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1071 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.11 
 
 		 1024 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1058 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1039 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1048 aa  398  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1041 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1028 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.58 
 
 		 1496 aa  393  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.05 
 
 		 1051 aa  391  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1048 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1034 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1055 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1017 aa  392  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1044 aa  389  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1036 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1006 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1050 aa  390  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  28.66 
 
 		 1042 aa  385  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1039 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1060 aa  386  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1029 aa  386  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1031 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  29.33 
 
 		 1069 aa  385  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1036 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1022 aa  382  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1037 aa  379  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  29.88 
 
 		 1037 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1095 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1035 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1040 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4318  acriflavin resistance protein  29.19 
 
 		 1041 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.329827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1041 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1037 aa  379  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1030 aa  376  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1014 aa  375  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  28.34 
 
 		 1037 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  27.99 
 
 		 1034 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1041 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1063 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.02 
 
 		 1068 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1041 aa  376  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.14 
 
 		 1024 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1059 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1031 aa  373  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1036 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  28.26 
 
 		 1036 aa  373  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1027 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 		 1036 aa  373  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  28.93 
 
 		 1088 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  29.16 
 
 		 1051 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  29.55 
 
 		 1166 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1036 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  27.72 
 
 		 1050 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>