More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2232 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  69.45 
 
 		 1079 aa  1410    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  71.48 
 
 		 1070 aa  1472    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  71.95 
 
 		 1087 aa  1538    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  64.63 
 
 		 1084 aa  1250    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1069 aa  2117    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3520  acriflavin resistance protein  71.05 
 
 		 1061 aa  1455    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2586  acriflavin resistance protein  71.05 
 
 		 1061 aa  1455    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  37.34 
 
 		 1057 aa  591  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 		 1011 aa  485  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2346  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1024 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  hitchhiker  0.00300678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 		 1082 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1044 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3831  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 		 1024 aa  465  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1034 aa  464  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.8 
 
 		 1081 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1086 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1050 aa  449  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1034 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1087 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 		 1043 aa  446  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1043 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 		 1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 		 1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1095 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1102 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1087 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1087 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 		 1085 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1087 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1083 aa  432  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.51 
 
 		 1044 aa  429  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1083 aa  429  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1053 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.82 
 
 		 1091 aa  426  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1024 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1046 aa  420  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1023 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1028 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1027 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1026 aa  409  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.7 
 
 		 1040 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.68 
 
 		 1049 aa  398  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  29.5 
 
 		 1068 aa  399  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1041 aa  392  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1032 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1470 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1044 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 		 1051 aa  389  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1048 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1058 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.99 
 
 		 1069 aa  383  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1041 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1050 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1039 aa  382  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1017 aa  382  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1055 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.03 
 
 		 1024 aa  380  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 		 1037 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.66 
 
 		 1038 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1042 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  28.02 
 
 		 1040 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1041 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1042 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1040 aa  378  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  29.66 
 
 		 1029 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1041 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1041 aa  379  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1036 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 		 1071 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2319  RND efflux transporter  29.67 
 
 		 1023 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.08 
 
 		 1036 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1022 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1060 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1048 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1058 aa  376  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1034 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1006 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1036 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  27.93 
 
 		 1051 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1033 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1038 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 		 1063 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 		 1028 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 		 1496 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.97 
 
 		 1024 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1042 aa  368  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1051 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1035 aa  369  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  27.38 
 
 		 1050 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  28.33 
 
 		 1032 aa  366  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  28.8 
 
 		 1036 aa  366  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1030 aa  365  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1048 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1044 aa  365  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1031 aa  365  3e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1039 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1028 aa  364  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1041 aa  363  6e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1040 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>